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Enregistrement W4404455557 · doi:10.1111/bjh.19895

Somatic co‐alteration signatures are prognostic in high‐grade <scp><i>TP53</i></scp>‐mutated myeloid neoplasms

2024· article· en· W4404455557 sur OpenAlexaff
Emily Symes, Peng Wang, Payal Sojitra, Madhu P. Menon, Anand Patel, Faheema Hasan, Sharmila Ghosh, Gregory W. Roloff, Qianghua Zhou, Talha Badar, Jingjing Zhang, Hamza Tariq, Hong Chang, Robert Bell, Anamarija M. Perry, Girish Venkataraman

Notice bibliographique

RevueBritish Journal of Haematology · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAcute Myeloid Leukemia Research
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésHazard ratioProportional hazards modelMyeloidSomatic cellInternal medicineCohortMedicineOncologySubgroup analysisGene signatureSurvival analysisGastroenterologyGeneBiologyGeneticsConfidence intervalGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

To assess the relevance of co-occurring somatic mutations in TP53-mutated myeloid neoplasms with ≥10% blasts, we pooled 325 individuals from 10 centres. We focused on comparing three published somatic co-alteration signatures comprising (1) nine MDS-related genes ('ICC-MDSR'), (2) ICC-MDSR + additional secondary mutations-related genes ('Tazi signature') and (3) EPI6 (comprising six genes). Outcomes examined were 24-month overall survival (OS24) and front-line complete response (CR1). The median age was 69 years with 77% receiving front-line hypomethylating agents (HMA). All three signatures ICC-MDSR (p = 0.009), Tazi signature (p = 0.001) and EPI6 (p = 0.025) predicted inferior CR1. In the low-intensity (HMA) subgroup, only Tazi signature (p = 0.026) predicted inferior CR1. In OS24 analysis of the HMA-treated subgroup (N = 200), only Tazi signature was adverse (hazard ratio, HR = 1.6 [1.1-2.2]; p = 0.011). However, a forward stepwise multivariable age-adjusted Cox model including all three signatures picked EPI6 as the sole significant adverse predictor in the entire cohort (p = 0.0001) as well as within the HMA-treated subgroup (p = 0.0071). These data confirm the value of testing co-occurring somatic alterations even within a high-grade TP53-mutated myeloid neoplasm cohort.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,288
Écart entre enseignants0,275 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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