Isolation, characterization and genome analysis of the orphan phage Kintu infecting Xanthomonas vasicola pv. musacearum
Notice bibliographique
Résumé
Xanthomonas vasicola pv. musacearum is responsible for the widespread Banana Xanthomonas Wilt in banana cultivation regions across the globe. Biocontrol measures for disease management remain limited amidst increasing antimicrobial resistance and unsustainable conventional agricultural practices. The purpose of this study is to explore a viable alternative or adjunct strategy through the use of bacteriophages for disease management. Kintu was isolated from sewage and displayed clear and circular plaques measuring 3 mm. Based on transmission electron microscopy, Kintu displays siphovirus characteristics, including an icosahedral head and a non-contractile tail. Kintu infects 78% (22 out of 28) Ugandan Xvm strains, has an optimal multiplicity of infection of 1, a 10 min adsorption and latent period, a 35 min burst period, and a burst size of 15 particles per bacterium. Phage titers remain stable for two and half months (75 days) in SM buffer at -20 o C and − 40 o C but decrease significantly ( p ≤ 0.0001) at 4 o C. Kintu is active at pH 3 and 11, maintains viability at temperatures between 25 o C and 120 o C and tolerates UV irradiation for up to 2 min and 20 s. Kintu inhibits Xvm growth at MOI ratios of 0.1, 1 and 10. The genome is a double stranded DNA molecule that consists of 48,985 base pairs and a G + C content of 51.71%. Antibiotic resistance genes or genes associated with a lysogenic life cycle are absent. There is limited sequence similarity of Kintu with other phages, making it a novel phage belonging to an unclassified genus of the class Caudoviricetes . Kintu is a novel bacteriophage that infects and lyses Xanthomonas vasicola pv. musacearum , the causative agent for Banana Xanthomonas Wilt. Its stability across diverse temperatures and pH conditions highlights its potential as a biocontrol agent for managing the disease.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».