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Enregistrement W4404493510 · doi:10.1101/2024.11.18.24316975

Epidemiological and Clinical Features of Mpox during the Clade Ib Outbreak in South-Kivu, Democratic Republic of the Congo: a Prospective Cohort Study

2024· preprint· en· W4404493510 sur OpenAlexaff
Isabel Brosius, Emmanuel Hasivirwe Vakaniaki, Guy Mukari, Papy Munganga, Jean Claude Tshomba, Elise De Vos, Eugene Bangwen, Yves Mujula, Achilleas Tsoumanis, Christophe Van Dijck, Aimé Alengo Odud, Léandre Mutimbwa-Mambo, Franklin Mweshi Kumbana, Jenestin Babingwa Muunga, Divin Mazambi Mambo, Jems Wakilongo Zangilwa, Steeven Bilembo Kitwanda, Sarah Houben, Nicole A. Hoff, Jean-Claude Makangara-Cigolo, Eddy Kinganda-Lusamaki, Martine Peeters, Anne W. Rimoin, Jason Kindrachuk, Nicola Low, Patrick DMC Katoto, Espoir Bwenge Malembaka, John Amuasi, Olivier Tshiani-Mbaya, Dally Muamba Kambaji, Richard Kojan, Cris Kacita, Daniel Mukadi‐Bamuleka, Steve Ahuka‐Mundeke, Koen Vercauteren, Tony Wawina-Bokalanga, Jean‐Jacques Muyembé‐Tamfum, Sabin S. Nundu, Laurens Liesenborghs, Placide Mbala‐Kingebeni

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiquePoxvirus research and outbreaks
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesEuropean and Developing Countries Clinical Trials Partnership
Mots-clésOutbreakEpidemiologyDemocracyCladeGeographyCohortEnvironmental healthMedicinePolitical scienceSocioeconomicsVirologyBiologyInternal medicineSociologyPolitics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background Clade Ib, a new strain of the Clade I monkeypox virus, emerged in Eastern Democratic Republic of the Congo, sparking an international outbreak. Comprehensive studies are needed to assess its transmission dynamics and clinical presentation. Methods We conducted a prospective observational cohort study at Kamituga General Hospital in South Kivu, DRC, between May 2 and October 9, 2024. Sociodemographic, exposure and clinical data were collected from mpox suspected cases. Cases confirmed by Xpert® Mpox PCR were presumed Clade Ib infections (awaiting Clade confirmation) and followed through hospitalization and on days 29 and 59 post-diagnosis to assess clinical progression and outcomes. Findings Of 511 included suspected cases, 431 (84%) tested PCR positive; with 205 being women (47%). Age distribution was bimodal, with 279 (65%) individuals aged 15-34 years, and 63 (15%) children under five. Most cases (59%) reported contact with a suspected or confirmed mpox case; among adults, this was primarily a spouse, colleague or sexual partner, while for children, the primary contacts were parents or siblings. Comorbidities were rare (4%), including six (1%) HIV infections. Prodromal symptoms were present in 346 (88%) patients, active skin lesions in 414 (96%), mucosal lesions in 338 (82%), and lymphadenopathy in 295 (71%). In adults, lesions were more concentrated in the genital area, with 90% of adults presenting lesions in this region. In contrast, only 39% of children had genital lesions, with lesions more frequently found elsewhere on the body. Among 427 hospitalized patients, two deaths (0·5%) occurred. Among 315 patients with detailed hospital follow-up, complications were primarily genito-urinary (55%) or cutaneous (40%). Four of six pregnant women with recorded outcome (67%) had adverse pregnancy outcomes. Significant sequelae at days 29 and 59 were rare. Interpretation Clade Ib MPXV infections presented differently from previously reported Clade Ia and Clade IIb infections. In adults, the disease primarily affected the genito-urinary system, compatible with sexual transmission, while children mostly manifested extragenital lesions. Funding European & Developing Countries Clinical Trials Partnership (EDCTP2 and EDCTP3); Belgian Directorate-General Development Cooperation and Humanitarian Aid; Research Foundation – Flanders

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Étiquettes directes de modèles (non validées)

Étiquettes de catégorie et de devis d'étude par modèle, issues des rondes d'étiquetage. C'est une sortie machine, non validée, et le désaccord entre modèles est livré comme donnée. Aucun devis ici n'est encore validé contre MEDLINE.

BrasCatégoriesDevis d'étudeConfiance
gemmaaucune catégorie
Domaine: non disponible · Genre: Empirique
Porte sur le système de recherche canadien: non · Porte sur un sujet canadien: non
Observationnellow
gptaucune catégorie
Domaine: non disponible · Genre: Empirique
Porte sur le système de recherche canadien: non · Porte sur un sujet canadien: non
Observationnelhigh
modèles en accordL'accord compare des ensembles de catégories et des devis identiques entre les bras.

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,016
Score d'incertitude au seuil0,032

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,029
Tête enseignante GPT0,332
Écart entre enseignants0,303 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Étiqueté directement par 2 modèles lisant le dossier complet.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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