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Enregistrement W4404495112 · doi:10.3389/fcimb.2024.1371655

Ectopic USP15 expression inhibits HIV-1 transcription involving changes in YY1 deubiquitination and stability

2024· article· en· W4404495112 sur OpenAlexfundno aff
Sahar Rezaei, Khalid Amine Timani, Ying Liu, Johnny J. He

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Cellular and Infection Microbiology · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueUbiquitin and proteasome pathways
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute on Drug AbuseNational Institutes of HealthNational Institute of Neurological Disorders and StrokeUniversity of North TexasNational Institute of Mental HealthUniversity of TorontoRosalind Franklin University of Medicine and Science
Mots-clésDeubiquitinating enzymeUbiquitinBiologyGene knockdownRepressorMolecular biologyTranscription (linguistics)Transcription factorYY1ProteasomeImmunoprecipitationGene expressionGeneCell biologyPromoterBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Introduction: Protein homeostasis is maintained by the opposing action of ubiquitin ligase and deubiquitinase, two important components of the ubiquitin-proteasome pathway, and contributes to both normal physiological and pathophysiological processes. The current study aims to delineate the roles of ubiquitin-specific protease 15 (USP15), a member of the largest deubiquitinase family, in HIV-1 gene expression and replication. Methods: We took advantage of highly selective and specific ubiquitin variants (UbV), which were recently designed and developed for USP15, and ascertained the inhibitory effects of USP15 on HIV-1 gene expression and production by transfection and Western blotting. We also used real-time RT-PCR, transcription factor profiling, subcellular fractionation, immunoprecipitation followed by Western blotting to determine the transcription factors involved and the underlying molecular mechanisms. Results: We first confirmed the specificity of USP15-mediated HIV-1 gene expression and virus production. We then showed that the inhibition of HIV-1 production by USP15 occurred at the transcription level, associated with an increased protein level of YY1, a known HIV-1 transcription repressor. Moreover, we demonstrated that USP15 regulated YY1 deubiquitination and stability. Lastly, we demonstrated that YY1 siRNA knockdown significantly diminished the inhibition of USP15 on HIV-1 gene expression and virus production. Conclusion: These findings together demonstrate that stabilization of YY1 protein by USP15 deubiquitinating activity contributes to USP15-mediated inhibition of HIV-1 transcription and may help the development of USP15-specific UbV inhibitors as an anti-HIV strategy.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,215
Écart entre enseignants0,204 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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