Dominant negative variants in <i>ITPR3</i> impair T cell Ca2+ dynamics causing combined immunodeficiency
Notice bibliographique
Résumé
The importance of calcium (Ca2+) as a second messenger in T cell signaling is exemplified by genetic deficiencies of STIM1 and ORAI1, which abolish store-operated Ca2+ entry (SOCE) resulting in combined immunodeficiency (CID). We report five unrelated patients with de novo missense variants in ITPR3, encoding a subunit of the inositol 1,4,5-trisphosphate receptor (IP3R), which forms a Ca2+ channel in the endoplasmic reticulum (ER) membrane responsible for the release of ER Ca2+ required to trigger SOCE, and for Ca2+ transfer to other organelles. The patients presented with CID, abnormal T cell Ca2+ homeostasis, incompletely penetrant ectodermal dysplasia, and multisystem disease. Their predominant T cell immunodeficiency is characterized by significant T cell lymphopenia, defects in late stages of thymic T cell development, and impaired function of peripheral T cells, including inadequate NF-κB- and NFAT-mediated, proliferative, and metabolic responses to activation. Pathogenicity is not due to haploinsufficiency, rather ITPR3 protein variants interfere with IP3R channel function leading to depletion of ER Ca2+ stores and blunted SOCE in T cells.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».