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Enregistrement W4404549740 · doi:10.1111/eva.70036

Tracking the North American Asian Longhorned Beetle Invasion With Genomics

2024· article· en· W4404549740 sur OpenAlexafffund
Mingming Cui, Amanda D. Roe, Brian Boyle, Melody A. Keena, Yunke Wu, W. Evan Braswell, Michael T. Smith, Ben Gasman, Juan Shi, Marion Javal, Geraldine Roux, Jean Turgeon, Richard C. Hamelin, Ilga Porth

Notice bibliographique

RevueEvolutionary Applications · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueForest Insect Ecology and Management
Établissements canadiensUniversity of British Columbia, Okanagan CampusUniversité LavalNatural Resources CanadaUniversity of British ColumbiaOkanagan University CollegeCanadian Food Inspection AgencyCanadian Forest Service
Organismes subventionnairesCanadian Forest ServiceNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanada First Research Excellence FundAlliance de recherche numérique du CanadaGenome CanadaCanadian Food Inspection AgencyChina Scholarship CouncilFPInnovationsNatural Resources CanadaGenome British Columbia
Mots-clésBiologyBiosecurityPopulation genomicsInvasive speciesEcologyGenomicsIntroduced speciesPopulationPopulation bottleneckPopulation geneticsEvolutionary biologyGenomeGeneticsMicrosatellite

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Biological invasions pose significant threats to ecological and economic stability, with invasive pests like the Asian longhorned beetle (Anoplophora glabripennis Motschulsky, ALB) causing substantial damage to forest ecosystems. Effective pest management relies on comprehensive knowledge of the insect's biology and invasion history. This study uses genomics to address these knowledge gaps and inform existing biosurveillance frameworks. We used 2768 genome‐wide single nucleotide polymorphisms to compare invasive A. glabripennis populations in North America, using genomic variation to trace their sources of invasion and spread patterns, thereby refining our understanding of this species' invasion history. We found that most North American A. glabripennis infestations were distinct, resulting from multiple independent introductions from the native range. Following their introduction, all invasive populations experienced a genetic bottleneck which was followed by a population expansion, with a few also showing secondary spread to satellite infestations. Our study provides a foundation for a genome‐based biosurveillance tool that can be used to clarify the origin of intercepted individuals, allowing regulatory agencies to strengthen biosecurity measures against this invasive beetle.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil0,018

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,210
Écart entre enseignants0,203 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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