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Enregistrement W4404595279 · doi:10.1038/s41588-024-01952-y

Genome-wide association analysis provides insights into the molecular etiology of dilated cardiomyopathy

2024· article· en· W4404595279 sur OpenAlexaff
Sean L. Zheng, Albert Henry, Douglas Cannie, Michael Lee, D.J. Miller, Kathryn A. McGurk, Isabelle Bond, Xiao Yun Xu, Hanane Issa, Catherine Francis, Antonio de Marvao, Pantazis Theotokis, Rachel Buchan, Doug Speed, Erik Abner, Lance Adams, Krishna G. Aragam, Johan Ärnlöv, Anna Axelsson Raja, Joshua Backman, John Baksi, Paul J.R. Barton, Kiran J. Biddinger, Eric Boersma, Jeffrey Brandimarto, Søren Brunak, Henning Bundgaard, David J. Carey, Philippe Charron, James P. Cook, Stuart A. Cook, Spiros Denaxas, Jean‐François Deleuze, Alex S. F. Doney, Perry Elliott, Christian Erikstrup, Tõnu Esko, Eric Farber‐Eger, Chris Finan, Sophie Garnier, Jonas Ghouse, Vilmantas Giedraitis, Daníel F. Guðbjartsson, Christopher M. Haggerty, Brian P. Halliday, Anna Helgadóttir, Harry Hemingway, Hans L. Hillege, Isabella Kardys, Lars Lind, Cecilia M. Lindgren, Brandon D. Lowery, Charlotte Manisty, Kenneth B. Margulies, James Moon, Ify Mordi, Michael P. Morley, Andrew D. Morris, Andrew P. Morris, Lori Morton, Mahdad Noursadeghi, Sisse Rye Ostrowski, Anjali Owens, Sanjay Prasad, Akshay Shekhar, Diane T. Smelser, Sundararajan Srinivasan, Kāri Stefánsson, Garðar Sveinbjörnsson, Petros Syrris, Mari‐Liis Tammesoo, Upasana Tayal, Maris Teder‐Laving, Unnur Thorsteinsdottir, Vinicius Tragante, David‐Alexandre Trégouët, Thomas A. Treibel, Henrik Ullum, Ana M. Valdes, Marion van Vugt, Abirami Veluchamy, W. M. Monique Verschuren, Eric Villard, Yifan Yang, Folkert W. Asselbergs, Marie‐Pierre Dubé, Patrick T. Ellinor, Chim C. Lang, Nilesh J. Samani, Svati H. Shah, J. G. Smith, Sundarajan Srinivasan, Ramachandran S. Vasan, W. M. Monique Verschuuren, Quinn S. Wells, Thomas P. Cappola, Aroon D. Hingorani, Declan P. O’Regan, Hilma Hólm, Michela Noseda, James S. Ware, R Thomas Lumbers

Notice bibliographique

RevueNature Genetics · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA modifications and cancer
Établissements canadiensUniversité de MontréalMontreal Heart Institute
Organismes subventionnairesMedical Research CouncilUniversity College LondonImperial College LondonRosetrees TrustDepartment of Health and Social CareNational Institute for Health and Care ResearchWellcome TrustBritish Heart FoundationCancer Research UKNovo Nordisk FondenIsrael Cancer Research Fund
Mots-clésDilated cardiomyopathyBiologyPenetranceGeneticsGenome-wide association studyBiobankCardiomyopathyGenetic associationMultifactorial InheritancePopulationHeart failureEtiologyBioinformaticsComputational biologyGeneSingle-nucleotide polymorphismInternal medicineMedicinePhenotypeGenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Dilated cardiomyopathy (DCM) is a leading cause of heart failure and cardiac transplantation. We report a genome-wide association study and multi-trait analysis of DCM (14,256 cases) and three left ventricular traits (36,203 UK Biobank participants). We identified 80 genomic risk loci and prioritized 62 putative effector genes, including several with rare variant DCM associations (MAP3K7, NEDD4L and SSPN). Using single-nucleus transcriptomics, we identify cellular states, biological pathways, and intracellular communications that drive pathogenesis. We demonstrate that polygenic scores predict DCM in the general population and modify penetrance in carriers of rare DCM variants. Our findings may inform the design of genetic testing strategies that incorporate polygenic background. They also provide insights into the molecular etiology of DCM that may facilitate the development of targeted therapeutics.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,642
Score d'incertitude au seuil0,359

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,240
Écart entre enseignants0,236 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations53
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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