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Enregistrement W4404642780 · doi:10.1161/jaha.123.033770

Hereditary Transthyretin Amyloidosis in Patients Referred to a Genetic Testing Program

2024· article· en· W4404642780 sur OpenAlexaffabout
Kunal Bhatt, Diego Delgado, Sami Khella, Naresh Bumma, Chafic Karam, Andrew Keller, Andrew M. Rosen, Ana Bozas, Amy Shea, Meghan C. Towne, Linda M. Polfus, Gwendolyn E. Kaeser, Victoria Sanjurjo, Keyur B. Shah

Notice bibliographique

RevueJournal of the American Heart Association · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAmyloidosis: Diagnosis, Treatment, Outcomes
Établissements canadiensToronto General HospitalUniversity of TorontoUniversity Health Network
Organismes subventionnairesArgenxAlexion PharmaceuticalsSanofiAstraZeneca
Mots-clésMedicineAmyloidosisGenetic testingTransthyretinCardiomyopathyDiseaseGenetic counselingFamily historyRestrictive cardiomyopathyInternal medicinePediatricsGeneticsHeart failure

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background Diagnosis of hereditary amyloid transthyretin (hATTR) amyloidosis with cardiomyopathy is frequently delayed, in large part because of symptom overlap with other cardiovascular diseases and limited provider knowledge of this disease. The sponsored and provider referred hATTR Compass Genetic Testing Program (Ionis, Carlsbad, CA; Ambry Genetics, Aliso Viejo, CA) provided no‐cost genetic testing to adults with a family history or clinical suspicion of hATTR amyloidosis. This study aims to characterize patients with hATTR amyloidosis and increase awareness of genetic testing for hATTR. Methods and Results Patients were referred to the hATTR genetic testing program, and a cross‐sectional post hoc analysis was performed. A pathogenic TTR variant was identified in 1503 (6.6%) of 22 886 patients referred for genetic testing between June 2018 and March 2022. Patients were identified in all US states, 3 US territories, and Canada. Median age at testing was 63 years, and 44% were female. The p.V142I TTR variant was the most common (n=1263, 84.0%). Only 32% of patients with a pathogenic TTR variant reported a known family history; a lower percentage of Black individuals reported a known family history compared with other racial and ethnic groups. Black patients accounted for 23.7% of all patients referred and 81.9% of patients with the p.V142I variant. Conclusions This sponsored genetic testing program identified a large number of patients with a pathogenic TTR variant, notably, in geographic regions not previously reported, and demographic groups that are historically underrepresented in the literature.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,012
Score d'incertitude au seuil0,023

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,281
Écart entre enseignants0,271 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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