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Enregistrement W4404652429 · doi:10.1101/2024.11.22.624912

A modular gate system for autonomous control of rodent behavior

2024· preprint· en· W4404652429 sur OpenAlexaff
Adam W. Lester, Nadira Djafri, Manu S. Madhav

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueNeural dynamics and brain function
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésComputer scienceModular designPython (programming language)Embedded systemSoftwareDocumentationExtensibilityConstruct (python library)Interface (matter)Operating systemProgramming language

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Rodent mazes have been used for decades to study the neural basis of behavior. Advancements in rapid prototyping techniques and access to affordable electronics allows laboratories with sufficient expertise in engineering and programming to customize and construct maze apparatuses and behavioral tasks, thereby increasing the ability of their studies to answer specific scientific questions. We designed and built a rodent gate system that lowers this bar of expertise even further. The NC4gate system is a robust mechanical design that can be built using low-cost hardware and execute thousands of cycles before maintenance. Up to 512 gates can be controlled using a single computer. Users can control the gates interactively using a Python-based graphical interface and programmatically using an extensible API. We hope that the open-source hardware / software and extensive documentation enables laboratories to build these affordable and robust gates and seamlessly incorporate automatic behavior control into their existing or new rodent tasks. Significance Statement Rodent mazes are used by thousands of laboratories and research institutions across the world to study learning and memory, as well as the effects of pharmacological, genetic and environmental manipulations. Ideally, maze and task designs should be customized to the scientific questions at hand. It is challenging, however, for many laboratories to build, program, and operate custom mazes, requiring them instead to rely on expensive and proprietary commercial solutions. The most complex components of most mazes are moving gates that restrict and direct rodent behavior. Here we provide the open-source hardware and software for a gate system that is extensible, affordable and robust, removing this critical barrier to customized mazes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,013
Score d'incertitude au seuil0,042

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0030,002
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0130,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,226
Écart entre enseignants0,208 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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