Establishing piperacillin–tazobactam susceptibility in ceftriaxone non-susceptible Enterobacterales: comparing disk diffusion, Etest, and VITEK 2 automated minimal inhibitory concentration measurements vs. broth microdilution
Notice bibliographique
Résumé
OBJECTIVES: Post-hoc analyses of the MERINO trial highlight the uncertainty associated with establishing piperacillin-tazobactam (PTZ) susceptibility in extended-spectrum beta-lactamase-producing Enterobacterales. Herein, we compare the concordance of susceptibility for PTZ among the VITEK 2, disc diffusion, and Etest with broth microdilution (BMD) as the reference standard. METHODS: Ninety-four consecutive ceftriaxone non-susceptible Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae bloodstream isolates were identified from patients at three hospitals in Montréal, Québec. BMD was used as the reference standard against which disc diffusion, VITEK 2 (AST-N391), and Etest susceptibility testing were compared. Errors were categorized as very major (false susceptible), major (false resistant), and minor (other). RESULTS: Overall, 68/94 (72.3%) of isolates were susceptible to PTZ by BMD. Disc diffusion made no major or very major errors (0%; 97.5% CI: 0-3.8%). The VITEK 2 system had a major error rate of 2.5% (95% CI: 0.003-0.089%) and a very major error rate of 26.7% (95% CI: 0.08-0.55%); however, all isolates with VITEK 2 minimal inhibitory concentrations (MICs) of ≤4 μg/mL were susceptible. Finally, the Etest had a major error rate of 6.3% (95% CI: 0.02-0.14%), but no very major errors. Combining VITEK 2-determined susceptibility with a second test led to an increase in the number of correctly classified susceptible organisms. DISCUSSION: The VITEK 2 system, and to a lesser extent the Etest, risk major errors. Used alone, the VITEK 2 system also risks very major errors if the estimated MIC is > 4 μg/mL. Combining VITEK 2 with disc diffusion in isolates with an estimated MIC of 8-16 μg/mL could prevent both major and very major errors.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,014 | 0,023 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».