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Enregistrement W4404664420 · doi:10.1002/jssc.70031

LC–MS‐Based Simultaneous Determination of Biomarkers in Dried Urine Spots for the Detection of Cofactor‐Dependent Metabolic Disorders in Neonates

2024· article· en· W4404664420 sur OpenAlexfundno aff
Arya Raveendran, Ashutosh Gupta, Leslie Lewis, Krishnananda Prabhu, Sudheer Moorkoth

Notice bibliographique

RevueJournal of Separation Science · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMetabolism and Genetic Disorders
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesGrand Challenges CanadaGovernment of Canada
Mots-clésUrineChromatographyNewborn screeningChemistrySpotsDried blood spotFormic acidIsoleucineValineLeucineAmino acidBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Deficiency of cofactors for various enzymes can lead to inborn errors of metabolism. These conditions frequently occur as seizures, which lead to permanent brain damage. Newborn screening for biomarkers associated with these disorders can help in early detection and treatment. Our objective was to establish a liquid chromatography mass spectrometry technique for quantifying biomarkers in dried urine spots to detect specific vitamin‐responsive inborn errors metabolism. Biomarkers were extracted from dried urine spots using a methanol:0.1% v/v formic acid solution (75:25) containing an internal standard mixture. Separation was achieved using a Luna PFP column (150 mm × 4.6 mm, 3 µm) under gradient elution conditions. The LC–MS technique was validated as per ICH M10 guidelines. Urine samples from healthy newborns in Udupi district, South India, were analyzed to establish reference values for these biomarkers. The method demonstrated excellent linearity ( R 2 > 0.99) with low limits of quantification: 0.1 µg/mL for leucine, isoleucine, valine, proline, hydroxyproline, methylmalonic acid, and 3‐hydroxyisovaleric acid; 0.01 µg/mL for pipecolic acid and α‐aminoadipic semialdehyde; and 0.03 µg/mL for piperideine‐6‐carboxylate. Interconvertibility between urine and dried urine spot assays was observed from the results of the regression and Bland–Altman analyses. Reference intervals for these biomarkers in the Udupi neonatal population were established using the validated dried urine spot method.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,309
Écart entre enseignants0,300 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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