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Enregistrement W4404692409 · doi:10.3390/metabo14120658

Global Lipidomics Reveals the Lipid Composition Heterogeneity of Extracellular Vesicles from Drug-Resistant Leishmania

2024· article· en· W4404692409 sur OpenAlexafffund
Sehyeon Kim, Ana Victoria Ibarra‐Meneses, Christopher Fernandez‐Prada, Tao Huan

Notice bibliographique

RevueMetabolites · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueResearch on Leishmaniasis Studies
Établissements canadiensUniversité de MontréalUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health ResearchUniversité de MontréalAzrieli FoundationCanada Foundation for InnovationUniversity of British ColumbiaInternational Development Research Centre
Mots-clésLipidomicsExtracellular vesiclesLeishmaniaDrugLipidomeVesicleComputational biologyDrug targetComposition (language)ExtracellularChemistryBiologyBioinformaticsPharmacologyCell biologyBiochemistryMembraneComputer scienceParasite hosting

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: The rise of drug-resistant Leishmania strains presents a significant challenge in the treatment of Leishmaniasis, a neglected tropical disease. Extracellular vesicles (EVs) produced by these parasites have gained attention for their role in drug resistance and host–pathogen interactions. Methods: This study developed and applied a novel lipidomics workflow to explore the lipid profiles of EVs from three types of drug-resistant Leishmania infatum strains compared to a wild-type strain. EVs were isolated through ultracentrifugation, and their lipid content was extracted using a modified Matyash protocol. LC-MS analysis was performed, and data processing in MS-DIAL enabled lipid identification and quantification. Statistical analysis in MetaboAnalyst revealed strain-specific lipid alterations, highlighting potential links between lipid composition and drug resistance mechanisms. Results: Our results show distinct alterations in lipid composition associated with drug resistance. Specifically, drug-resistant strains exhibited reduced levels of phosphatidylcholine (PC) and phosphatidylglycerol (PG), particularly in the amphotericin B-resistant strain LiAmB1000.1. Sterol and glycerolipid species, including cholesteryl ester (CE) and triacylglycerol (TG) were also found to be diminished in LiAmB1000.1. These changes suggest significant lipid remodeling under drug pressure, potentially altering the biophysical properties of EV membranes and their capacity for molecule transfer. Furthermore, the lipidomic profiles of EVs from the other resistant strains, LiSb2000.1 and LiMF200.5, also displayed unique alterations, underscoring strain-specific adaptations to different drug resistance mechanisms. Conclusions: These significant alterations in lipid composition suggest potential lipid-based mechanisms underlying drug resistance in Leishmania, providing new avenues for therapeutic intervention.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,487
Score d'incertitude au seuil0,680

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,301
Écart entre enseignants0,275 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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