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Enregistrement W4404695602 · doi:10.1128/jcm.01535-24

Emergence of terbinafine-resistant <i>Trichophyton indotineae</i> in Ontario, Canada, 2014–2023

2024· article· en· W4404695602 sur OpenAlexaffabout
Lisa R. McTaggart, Kirby Cronin, Sonja Ruscica, Samir N. Patel, Julianne V. Kus

Notice bibliographique

RevueJournal of Clinical Microbiology · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueNail Diseases and Treatments
Établissements canadiensUniversity of TorontoPublic Health Ontario
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTerbinafineTrichophytonMicrobiologyMedicineBiologyAntifungalItraconazole

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Trichophyton indotineae is an emerging fungal pathogen capable of causing extensive recalcitrant dermatophytosis exacerbated by frequently retained terbinafine resistance. Cases of dermatophytosis due to T. indotineae have increased dramatically in India in recent years. Other countries have reported imported infection cases, causing public health concerns over the potential global spread of this drug-resistant pathogen. We describe T. indotineae from 47 clinical cases in Ontario, Canada, from 2014 to 2023, based on 50 isolates received by the provincial public health laboratory. Although detected in Ontario as early as 2014, cases increased sharply in 2022–2023. The majority of cases were found in 20 to 64-year-olds (83.0%). Cases from 2022 to 2023 were noted in only 8 of 34 public health units, clustering in large urban centers. Based on genomic epidemiology, Ontario isolates were genetically similar to isolates from other countries. Neither temporal nor geographic clustering based on country or public health unit was observed, suggesting Ontario cases represented recent introductions from endemic regions, although limited local transmission cannot be ruled out. Genome diversity (4.4 × 10 −6 ) was extremely low, consistent with the hypothesized recent emergence and clonal population structure of T. indotineae . Most (71.4%) cases were terbinafine-resistant, with isolates exhibiting either the L393F/L393S ( n = 3) or F397L ( n = 27) squalene epoxidase substitution. Decreased susceptibility to itraconazole or voriconazole was found among 23.7% of isolates and was frequently associated with CYP51B gene duplication. Terbinafine-resistant T. indotineae infections are escalating in Ontario, meriting enhanced laboratory detection methods and public health efforts to increase the awareness of recalcitrant dermatophytoses in order to promptly initiate appropriate treatment and control transmission. IMPORTANCE Cases of dermatophytosis caused by emerging pathogen Trichophyton indotineae are increasing worldwide. Many are resistant to first-line treatment option terbinafine, resulting in difficult-to-treat cases. We describe the emergence of cases of T. indotineae infections in Ontario, Canada. The incidence in primarily urban centers increased dramatically in 2022–2023, with a large percentage of isolates resistant to terbinafine. Decreased susceptibility to azoles was also observed for some isolates, raising concern over the potential evolution of multi-drug resistance. Ontario T. indotineae isolates were genetically similar to those from disparate locales worldwide, signifying the global nature of this public health concern. Together with other reports, this study serves to raise public health awareness to promote better laboratory detection procedures, prompt appropriate treatment of recalcitrant dermatophytoses, and inform infection prevention and control measures.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,410
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,339
Écart entre enseignants0,313 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations31
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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