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Enregistrement W4404711328 · doi:10.3390/ijms252312711

The Role of Glutamate Metabolism and the GABA Shunt in Bypassing the Tricarboxylic Acid Cycle in the Light

2024· article· en· W4404711328 sur OpenAlexaff
А. Т. Епринцев, Г. Б. Анохина, Zakhar N. Shakhov, Polina P. Moskvina, Abir U. Igamberdiev

Notice bibliographique

RevueInternational Journal of Molecular Sciences · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueGABA and Rice Research
Établissements canadiensMemorial University of Newfoundland
Organismes subventionnairesMinistry of Science and Higher Education of the Russian Federation
Mots-clésGABA transaminaseBiochemistryGlutamate decarboxylaseGlutamate dehydrogenaseGlutamate receptorCitric acid cycleTransaminaseBiologyMetabolismFar-redPhytochromeEnzymeChemistryRed lightBotany

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Glutamate is an essential amino acid in both the energy and biosynthetic processes in plant cells. The aim of this work was to study changes in glutamate metabolism upon irradiation of maize (Zea mays L.) leaves with light of different spectral compositions, as well as to identify mechanisms regulating the work of enzymes involved in the studied process. A study was conducted of light-induced changes in glutamate metabolism in maize leaves, mediated by redirecting the glutamate flow to the γ-aminobutyric acid (GABA) shunt. Glutamate dehydrogenase (GDH) was more active in darkness, and the irradiation by red light inhibited the expression of both the Gdh1 and Gdh2 genes. EGTA and ruthenium red abolished the effects of light, indicating the participation of Ca2+ ions in phytochrome signal transduction. Contrary to GDH, glutamate decarboxylase (GAD) activity was moderately higher in the light, stimulated by red light, while far-red light reversed the effect. The effect of light on Gad expression was more pronounced than on GAD activity. Irradiation by red light also resulted in the increase in activity of GABA transaminase (GTA), which was abolished by far-red light. The third enzyme of the GABA shunt, succinic semialdehyde dehydrogenase (SSADH), was also activated by light. The effect of light on the expression of Ssadh1, but not on Ssadh2, was phytochrome-dependent. It is concluded that irradiation by light shifts glutamate metabolism from GDH to GAD with the activation of GABA transaminase and SSADH. This suggests that the GABA pathway plays a role in the maintenance of the tricarboxylic acid cycle in the light via bypassing its reactions when the 2-oxoglutarate dehydrogenase complex is inhibited and the cycle switches to the open mode.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,270
Écart entre enseignants0,260 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations16
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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