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Enregistrement W4404718354 · doi:10.1002/adma.202411173

Bacteriophage‐Activated DNAzyme Hydrogels Combined with Machine Learning Enable Point‐of‐Use Colorimetric Detection of <i>Escherichia coli</i>

2024· article· en· W4404718354 sur OpenAlexafffund
Hannah Mann, Shadman Khan, Akansha Prasad, Fereshteh Bayat, Jimmy Gu, Kyle Jackson, Yingfu Li, Zeinab Hosseinidoust, Tohid F. Didar, Carlos D. M. Filipe

Notice bibliographique

RevueAdvanced Materials · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineEngineering
ThématiqueBiosensors and Analytical Detection
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanada Research ChairsMichael G. DeGroote Institute for Infectious Disease Research, McMaster UniversityGovernment of OntarioMcMaster University
Mots-clésDeoxyribozymeEscherichia coliNanotechnologyAptamerPopulationMaterials scienceBacteriophageCleaveDetection limitComputational biologyBiologyDNAChemistryMolecular biologyBiochemistryChromatographyMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Developing cost‐effective, consumer‐accessible platforms for point‐of‐use environmental and clinical pathogen testing is a priority, to reduce reliance on laborious, time‐consuming culturing approaches. Unfortunately, a system offering ultrasensitive detection capabilities in a form that requires little auxiliary equipment or training has remained elusive. Here, a colorimetric DNAzyme‐crosslinked hydrogel sensor is presented. In the presence of a target pathogen, DNAzyme cleavage results in hydrogel dissolution, yielding the release of entrapped gold nanoparticles in a manner visible to the naked eye. Recognizing that Escherichia coli holds high relevance within both environmental and clinical environments, an E. coli ‐responsive DNAzyme is incorporated into this platform. Through the optimization of the hydrogel polymerization process and the discovery of bacteriophage‐induced DNAzyme signal amplification, 10 1 CFU mL −1 E. coli is detected within real‐world lake water samples. Subsequent pairing with an artificial intelligence model removed ambiguity in sensor readout, offering 96% true positive and 100% true negative accuracy. Finally, high sensor specificity and stability results supported clinical use, where 100% of urine samples collected from patients with E. coli urinary tract infections are accurately identified. No false positives are observed when testing healthy samples. Ultimately, this platform stands to significantly improve population health by substantially increasing pathogen testing accessibility.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,690

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,190
Écart entre enseignants0,185 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations39
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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