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Enregistrement W4404764855 · doi:10.1186/s12864-024-11038-y

Lnc-MEG8 regulates yak myoblast differentiation via the miR-22-3p/RTL1 axis

2024· article· en· W4404764855 sur OpenAlexaff
Xiaoming Ma, Yongfu La, Tong Wang, Chun Huang, Feng Fen, Xian Guo, Pengjia Bao, Xiaoyun Wu, Min Chu, Chunnian Liang, Ping Yan

Notice bibliographique

RevueBMC Genomics · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMuscle Physiology and Disorders
Établissements canadiensMinistry of Agriculture
Organismes subventionnairesAgricultural Science and Technology Innovation ProgramNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésBiologyMyocyteTranscriptomeCell biologyMYF5Myogenic regulatory factorsGene silencingSkeletal muscleMyostatinGene expressionGeneticsGeneMyoDMyogenesisAnatomy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: The yak (Bos grunniens) is essential to the livelihoods of Tibetan people on the Qinghai-Tibet Plateau; however, its growth and productivity are constrained by the region's harsh climate and high altitude. Yak skeletal muscle myoblasts, which have evolved to thrive under these challenging conditions, offer a valuable model for investigating muscle development. In this study, we performed transcriptome profiling of yak longissimus dorsi muscle at different growth stages, identifying a key long non-coding RNA, LncRNA-XR_314844 (Lnc-MEG8), with a potential role in muscle development. RESULTS: We developed a novel technique to isolate high-quality yak myoblasts, enabling detailed analysis of Lnc-MEG8. Our results indicated that Lnc-MEG8's subcellular localization varies during muscle cell growth: it is found in both the nucleus and cytoplasm during proliferation but shifts mainly to the cytoplasm during differentiation. Functional experiments showed that Lnc-MEG8 promotes cell proliferation and inhibits differentiation, while its silencing had the opposite effect. Further analysis revealed that both Lnc-MEG8 and the gene RTL1 share miR-22-3p as a common target. Dual-luciferase assays confirmed miR-22-3p directly targets both Lnc-MEG8 and RTL1 mRNA. Co-transfection of Lnc-MEG8 and a miR-22-3p mimic restored RTL1 expression, highlighting Lnc-MEG8's regulatory role. Lnc-MEG8 also counteracts miR-22-3p's suppression of key muscle genes such as MyF5 and MyoG, facilitating myotube formation. CONCLUSION: These findings demonstrate that the Lnc-MEG8-miR-22-3p-RTL1 axis plays a crucial role in yak muscle development, providing insights that could advance muscle tissue engineering and enhance yak meat quality.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,221
Écart entre enseignants0,212 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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