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Enregistrement W4404793832 · doi:10.1093/jpe/rtae105

Structure and functions of soil microbial communities and tree composition are more closely associated with keystone microbes than rare microbes in a subtropical forest

2024· article· en· W4404793832 sur OpenAlexafffund
Wu Xian, David C. Deane, Hua Xing, Jiarong Yang, Junfang Chen, Xiaolin Liu, Shu Dong, Fangliang He, Yu Liu

Notice bibliographique

RevueJournal of Plant Ecology · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueMicrobial Community Ecology and Physiology
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésEcologySubtropicsTropical and subtropical moist broadleaf forestsBiologyComposition (language)Microbial ecologyBacteriaPaleontology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The significance of microbes for ecosystem functioning is well known; however, within a single system, the relative contributions of keystone and rare taxa to soil microbial functions are less well quantified, as are their shared or unique responses to abiotic conditions. Furthermore, their associations with tree community composition in natural forest ecosystems are not well understood. In this study, a total of 1287 soil samples were collected from a 20-ha subtropical forest plot and analyzed using high-throughput sequencing. Based on co-occurrence network analyses, we conducted a comparison of the associations between keystone and rare taxa with the structure, functions and stability of soil microbial communities. Additionally, we examined their associations with tree community composition. Results showed that keystone taxa made a significantly greater contribution than rare taxa in all comparisons of microbial functions and stability. Keystone taxa had direct effects on microbial community structure and also mediated indirect effects of abiotic conditions. Neither effect was evident for rare taxa. The importance of keystone taxa also extended to aboveground composition, where tree community composition was more closely associated with keystone taxa than with rare taxa. While it may still be premature to establish causality, our study represents one of the initial attempts to compare the relative importance of keystone and rare microbial taxa in forest soils. These findings offer the potential to improve natural forest ecosystem functioning and tree diversity through the manipulation of a small number of keystone soil microbial taxa, as has been demonstrated in agroecosystems.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,280
Score d'incertitude au seuil0,855

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,196
Écart entre enseignants0,189 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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