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Enregistrement W4404830807 · doi:10.1186/s13048-024-01555-5

Searching for the ‘X’ factor: investigating the genetics of primary ovarian insufficiency

2024· review· en· W4404830807 sur OpenAlexaff
Alec Knight, Sara Sugin, Andrea Jurisicova

Notice bibliographique

RevueJournal of Ovarian Research · 2024
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic and Clinical Aspects of Sex Determination and Chromosomal Abnormalities
Établissements canadiensLunenfeld-Tanenbaum Research InstituteUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCandidate genePremature ovarian insufficiencyGeneticsGeneBiologyBioinformaticsComputational biologyMedicineInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Primary ovarian insufficiency (POI) is the cessation of ovarian function before the age of 40. The causes of POI are heterogeneous, but substantial evidence exists to support a genetic basis of POI, particularly in the critical involvement of genes on the X chromosome. Recent studies have revealed novel candidate genes through the identification of copy number variations associated with POI. This review summarizes the genes located on the X chromosome with variants shown to be associated with POI in humans and/or in mice. Additionally, we present evidence to support the potential involvement of these candidate genes in the etiology of POI. We conducted a literature search in PubMed to identify case studies and screenings for the genetic causes of POI. We then performed systematic searches for the proposed candidate genes to investigate their potential reproductive roles. Of the X-linked candidate genes investigated, 10 were found to have variants associated with cases of POI in humans. An additional 10 genes were found to play a supportive role in POI. Other genes were not implicated in any cases of POI but were associated with various roles in reproduction. In the majority of cases where variants were identified through whole-exome sequencing, rather than targeted screening of candidate genes, more than one genetic variant was identified. Overall, this review supports past findings that the X chromosome plays a critical role in ovarian function, as demonstrated by a link between POI and various disruptions to genes on the X chromosome. Current genetic screening for POI, which includes only FMR1, is inadequate to capture the majority of cases with a genetic origin. An expanded genetic testing may improve health outcomes for individuals with POI as it could lead to better early interventions and education about these health risks.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,004
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,992
Score d'incertitude au seuil0,493

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0040,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,193
Tête enseignante GPT0,446
Écart entre enseignants0,252 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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