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Enregistrement W4404834643 · doi:10.23876/j.krcp.23.250

Circulating microRNAs as markers for scrub typhus-associated acute kidney injury

2024· article· en· W4404834643 sur OpenAlexaff
Haeun Lee, Jung Min Kim, A Young Cho, Ju Hwan Oh, Kwang Young Lee, Chang‐Seop Lee, In O Sun

Notice bibliographique

RevueKidney Research and Clinical Practice · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMicroRNA in disease regulation
Établissements canadiensNexen (Canada)
Organismes subventionnairesBiomedical Research Institute, Jeonbuk National University Hospital
Mots-clésAcute kidney injuryScrub typhusMedicinemicroRNADownregulation and upregulationInternal medicineMicroarrayPathologyGeneGene expressionBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Circulating microRNAs (miRNAs) are potential biomarkers for various kidney diseases. In this study, we aimed to identify a circulating miRNA signature for detecting acute kidney injury (AKI) in scrub typhus. METHODS: We prospectively enrolled 40 patients with scrub typhus (20 with AKI, AKI group; 20 without AKI, non-AKI group) and 20 healthy volunteers (the HV group). Thereafter, we performed microarray analysis to assess the serum miRNA profiles of all the participants. Then, to identify miRNAs predictive of scrub typhus-associated AKI, we compared miRNA profiles among these three groups. RESULTS: The proportions of miRNAs, small nucleolar RNAs, and small Cajal body-specific ribonucleoproteins were higher in patients with scrub typhus than in the HVs. Further, relative to the HVs, we identified 120 upregulated and 449 downregulated miRNAs in the non-AKI group and 101 upregulated and 468 downregulated miRNAs in the AKI group. We also identified 11 and 110 upregulated and downregulated miRNAs, respectively, in the AKI group relative to the non-AKI group, and among these miRNAs, we noted 14 miRNAs whose levels were significantly upregulated or downregulated in the AKI group relative to their levels in the HV and non-AKI groups. Biological pathway analysis of these 14 miRNAs indicated their potential involvement in various pathways associated with tumor necrosis factor alpha. CONCLUSION: We identified miRNAs associated with AKI in patients with scrub typhus that have predictive potential for AKI. Thus, they can be used as surrogate markers for the detection of scrub typhus-associated AKI.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,053
Tête enseignante GPT0,464
Écart entre enseignants0,411 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission1
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