Vacuolar pH regulates clathrin-mediated endocytosis through TORC1 signaling during yeast replicative aging
Notice bibliographique
Résumé
ABSTRACT Clathrin-mediated endocytosis (CME) is a critical cellular process that regulates nutrient uptake, membrane composition and signalling. While cellular aging is associated with functional changes across many cellular components contributing to the collective decline in cellular function, little is known about how it affects CME. Here we show that CME dynamics are significantly altered during replicative aging in budding yeast, with older cells having slower assembly of early and coat CME modules, resulting in longer endocytic turnover and reduced cargo internalization. This change in CME dynamics is mother cell-specific and is not observed in daughter cells. We identified vacuolar pH, a key driver of aging phenotypes in budding yeast, as a central player in this modulation of CME dynamics during aging. Perturbing vacuolar pH in young cells mimics aging-like CME dynamics, while maintaining an acidic vacuolar pH in aging cells preserves CME dynamics typical of young cells. Finally, we demonstrate that the vacuolar pH effect on CME is regulated through TORC1 via the effector kinase Npr1. These findings establish vacuolar pH as a critical regulator of CME during cellular aging, and strengthen its role in the overall cellular aging process in budding yeast.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».