Direct and indirect RANK and CD40 signaling regulate the maintenance of thymic epithelial cell frequency and properties in the adult thymus
Notice bibliographique
Résumé
Medullary thymic epithelial cells (mTECs) play a crucial role in suppressing the onset of autoimmunity by eliminating autoreactive T cells and promoting the development of regulatory T cells in the thymus. Although mTECs undergo turnover in adults, the molecular mechanisms behind this process remain unclear. This study describes the direct and indirect roles of receptor activator of NF-κB (RANK) and CD40 signaling in TECs in the adult thymus. Flow cytometric and single-cell RNA-seq (scRNA-seq) analyses suggest that the depletion of both RANK and CD40 signaling inhibits mTEC differentiation from CCL21+ mTEC progenitors to transit-amplifying TECs in the adult thymus. Unexpectedly, this depletion also exerts indirect effects on the gene expression of TEC progenitors and cortical TECs. Additionally, the expression levels of AP-1 genes, which enable the further subdivision of TEC progenitors, are up-regulated following the depletion of RANK and CD40 signaling. Overall, our data propose that RANK and CD40 signaling cooperatively maintain mature mTEC frequency in the adult thymus and sustain the characteristics of TEC progenitors through an indirect mechanism.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».