Mixed nontuberculous mycobacteria in an immunocompromised patient with probable progressive multifocal leukoencephalopathy
Notice bibliographique
Résumé
• Concurrent pulmonary and disseminated nontuberculous mycobacteria (NTM) disease can involve multiple species. • Line probe assays may fail to detect NTM mixtures from pulmonary specimen cultures. • Mixed NTM infections can be either pathogenic or non-pathogenic. • Multi-target amplicon sequencing is better for detecting NTM mixtures. • Dual NTM treatment is complex, requiring a personalized regimen and expert input. Nontuberculous mycobacteria (NTM) are increasingly recognized opportunistic pathogens found ubiquitously in the environment. The presence of multiple NTM species at the site of disease complicates diagnosis and treatment. A 40-year-old patient who tested positive for HIV, with an absolute clusters of differentiation 4+ T-cell count of 3 cells/µl and cryptococcaemia, presented with hemoptysis, productive cough, and weight loss. Mixed NTM species, including Mycobacterium kansasii and Mycobacterium chelonae, were detected by the GenoType Mycobacterium Common Mycobacteria line probe assay from respiratory specimens, with Mycobacterium avium bacteremia also identified in the same month. An empirical regimen of azithromycin, ethambutol, isoniazid, and rifabutin was initiated to address recurrent positive cultures with M. kansasii and the NTM bacteremia. Despite this treatment, the patient experienced neurologic deterioration, was diagnosed with probable progressive multifocal leukoencephalopathy, and subsequently died. Advanced diagnostic techniques, including Sanger sequencing, Deeplex Myc-TB in combination with short-read next-generation sequencing, and targeted amplicon-based Oxford Nanopore Technologies long-read sequencing, revealed the presence of mixed NTM species in two retrospective stored cultures, with variations in primer binding affinity among the M. kansasii and M. avium . This case highlights the individualized considerations required to manage a patient with mixed NTM infection and the need for multi-target diagnostic approaches.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,003 | 0,003 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».