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Enregistrement W4404867262 · doi:10.1038/s41598-024-81170-y

De-identification is not enough: a comparison between de-identified and synthetic clinical notes

2024· article· en· W4404867262 sur OpenAlexafffund
Atiquer Rahman Sarkar, Yao-Shun Chuang, Noman Mohammed, Xiaoqian Jiang

Notice bibliographique

RevueScientific Reports · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiquePrivacy-Preserving Technologies in Data
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesNational Human Genome Research InstituteU.S. National Library of MedicineNational Institute on AgingNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaUniversity of Texas Health Science Center at HoustonUniversity of ManitobaNational Cancer InstituteNational Science FoundationNational Institutes of HealthCancer Prevention and Research Institute of Texas
Mots-clésComputer scienceIdentification (biology)InferenceSynthetic dataTask (project management)Machine learningArtificial intelligenceGenerative modelGenerative grammarSafeguardingData miningData scienceMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

For sharing privacy-sensitive data, de-identification is commonly regarded as adequate for safeguarding privacy. Synthetic data is also being considered as a privacy-preserving alternative. Recent successes with numerical and tabular data generative models and the breakthroughs in large generative language models raise the question of whether synthetically generated clinical notes could be a viable alternative to real notes for research purposes. In this work, we demonstrated that (i) de-identification of real clinical notes does not protect records against a membership inference attack, (ii) proposed a novel approach to generate synthetic clinical notes using the current state-of-the-art large language models, (iii) evaluated the performance of the synthetically generated notes in a clinical domain task, and (iv) proposed a way to mount a membership inference attack where the target model is trained with synthetic data. We observed that when synthetically generated notes closely match the performance of real data, they also exhibit similar privacy concerns to the real data. Whether other approaches to synthetically generated clinical notes could offer better trade-offs and become a better alternative to sensitive real notes warrants further investigation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,009
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,020
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche, Communication savante, Science ouverte
Catégories consensuellesScience ouverte
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,554
Score d'incertitude au seuil0,998

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0090,020
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0040,001
Science ouverte0,0070,017
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,086
Tête enseignante GPT0,374
Écart entre enseignants0,288 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations24
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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