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Enregistrement W4404872437 · doi:10.1038/s41598-024-79390-3

Predicting cortical-thalamic functional connectivity using functional near-infrared spectroscopy and graph convolutional networks

2024· article· en· W4404872437 sur OpenAlexafffund
Lingkai Tang, Lilian Kebaya, Homa Vahidi, Paige Meyerink, Sandrine de Ribaupierre, Soume Bhattacharya, Keith St. Lawrence, Emma G. Duerden

Notice bibliographique

RevueScientific Reports · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueOptical Imaging and Spectroscopy Techniques
Établissements canadiensUniversity of TorontoWestern University
Organismes subventionnairesChildren’s Health FoundationCanadian Institutes of Health ResearchChildren's Health FoundationNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaFondation Brain Canada
Mots-clésFunctional near-infrared spectroscopyComputer scienceFunctional connectivityFunctional magnetic resonance imagingArtificial intelligenceConvolutional neural networkThalamusSupport vector machineBinary classificationGraphPattern recognition (psychology)Machine learningNeuroscienceCognitionPsychologyPrefrontal cortex

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Functional near-infrared spectroscopy (fNIRS) measures cortical hemodynamic changes, yet it cannot collect this information from subcortical structures, such as the thalamus, which is involved in several key functional networks. To address this drawback, we propose a machine-learning-based approach to predict cortical-thalamic functional connectivity using cortical fNIRS data. We applied graph convolutional networks (GCN) to two datasets obtained from healthy adults and neonates with early brain injuries, respectively. Each dataset contained fNIRS connectivity data as input to the predictive models, while the connectivity from functional magnetic resonance imaging (fMRI) served as training targets. GCN models performed better compared to conventional methods, such as support vector machine and feedforward fully connected artificial neural networks, on both identifying the connections as binary classification tasks, and regressing the quantified strengths of connections. We also propose the addition of inter-subject connections into the GCN kernels could improve performance and that GCN models are resilient to noise in fNIRS data. Our results show it is feasible to identify subcortical activity from cortical fNIRS recordings. The findings can potentially extend the use of fNIRS in clinical settings for brain monitoring in critically ill patients.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,770
Score d'incertitude au seuil0,805

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,286
Écart entre enseignants0,266 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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