Re-evaluating the utility of iron indices in hereditary hemochromatosis genotyping: A retrospective study
Notice bibliographique
Résumé
INTRODUCTION: Hereditary hemochromatosis (HH), associated with C282Y or H63D mutations in the HFE gene, is the commonest genetic disorder in Canada. The majority of HH cases are attributable to C282Y homozygosity which can precipitate iron overload and organ damage, but with low penetrance. Elevated transferrin saturation (TSat) and ferritin levels are key biochemical indicators of iron overload in C282Y homozygotes. This retrospective study examined TSat and ferritin levels as predictors of C282Y homozygosity in genotyped patients. METHODS: This study included 23,432 individuals from Maritime provinces who underwent HFE genotyping from 2009 to 2022. Those with available biomarkers (TSat, ferritin, ALT) were included in the study sample. C282Y and H63D variants were identified based on HFE genotying. Median values for each biomarker were compared across genotypes and their diagnostic performance in predicting C282Y homozygosity evaluated using ROC analysis. RESULTS: 1241 individuals (5.3 %) showed C282Y homozygosity, marking the largest North American study cohort. C282Y homozygotes showed significantly higher median TSat and ferritin levels than wildtypes. TSat showed the best diagnostic performance in detecting C282Y homozygosity (AUC = 0.82, 95 % CI: 0.78-0.85), outperforming ferritin (AUC = 0.54, 95 % CI: 0.50-0.58) and ALT (AUC = 0.59, 95 % CI: 0.56-0.63). TSat thresholds of 32 % (females) and 35 % (males) had a 90 % sensitivity for C282Y homozygosity. Using thresholds of TSat ≤46 % and ferritin ≤370 µg/L (females), and TSat ≤49 % and ferritin ≤703 µg/L (males) reduced the need for genotyping by up to 50 % without missing significant biochemical iron overload cases. Implementing this strategy across 23,432 tests could save $1,701,163 and potentially reduce unnecessary downstream management. CONCLUSION: Our study suggests significant efficiency savings by implementing an algorithm to reduce unnecessary HFE genotyping and alleviate unwarranted genetic testing anxiety.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,004 | 0,010 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».