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Enregistrement W4404911388 · doi:10.1094/phytofr-09-24-0105-fi

Optical Density Assay to Determine the Sensitivity of <i>Globisporangium</i> and <i>Pythium</i> Isolates to Mefenoxam

2024· article· en· W4404911388 sur OpenAlexafffundabout
Umbrin Ilyas, Lindsey J. du Toit, Mary Ruth McDonald

Notice bibliographique

RevuePhytoFrontiers™ · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Pathogens and Resistance
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesOntario Agri-Food Innovation AllianceWashington State UniversityNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaNorthwestern University
Mots-clésPythiumSensitivity (control systems)BiologyPhysicsHorticultureEngineeringElectronic engineering

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Several species of Globisporangium and Pythium cause cavity spot of carrot. Disease management in conventional production relies primarily on application of the fungicide mefenoxam. Growers’ reports in Ontario, Canada, of severe cavity spot, even when using mefenoxam applications, suggest that mefenoxam resistance may be prevalent in pathogen populations in this region. The objectives of the study were to develop a rapid and accurate optical density (OD) assay to assess mefenoxam sensitivity of 188 isolates of Globisporangium and Pythium species collected from 13 carrot fields in Ontario from 2020 to 2023. The isolates belonged to seven species: G. intermedium, G. irregulare, G. rostratifingens, G. sylvaticum, G. ultimum, G. violae, and P. sulcatum. The OD was measured at 600 nm in broth amended with different concentrations of mefenoxam, with OD readings at nine positions per well in a 96-well plate. The OD assay was validated by comparing half maximal effective concentration values with a standard fungicide-amended agar medium assay using 20 representative isolates. There was a significant linear relationship ( R 2 = 0.97, P < 0.0001) between the two assays. Of the 188 isolates tested, 24% exhibited <60% inhibition of mycelial growth at 5 μg ml −1 mefenoxam, 50% were inhibited by >60% at 5 μg ml −1 , 19% were inhibited by >60% at 1 μg ml −1 , and 7% were inhibited by >60% even at 0.1 μg ml −1 . The OD assay proved to be efficient, rapid, and accurate for monitoring the mefenoxam sensitivity of these oomycetes. [Formula: see text] Copyright © 2025 The Author(s). This is an open access article distributed under the CC BY-NC-ND 4.0 International license .

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,015
Score d'incertitude au seuil0,029

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,202
Écart entre enseignants0,191 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2024
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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