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Enregistrement W4404953253 · doi:10.1038/s41467-024-54975-8

Differential activity of MAPK signalling defines fibroblast subtypes in pancreatic cancer

2024· article· en· W4404953253 sur OpenAlexfundno aff
Lisa Veghini, Davide Pasini, Rui Fang, Pietro Delfino, Dea Filippini, Christian Neander, Caterina Vicentini, Elena Fiorini, Francesca Lupo, Sabrina L. D’Agosto, Carmine Carbone, Antonio De Agostini, Geny Piro, Michele Bevere, P. M. Markus, Diana Behrens, Claudio Luchini, Rita T. Lawlor, Aldo Scarpa, Giulia Biffi, Phyllis F. Cheung, Jens T. Siveke, Vincenzo Corbo

Notice bibliographique

RevueNature Communications · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePancreatic and Hepatic Oncology Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteMinisterium für Kultur und Wissenschaft des Landes Nordrhein-WestfalenDeutschen Konsortium für Translationale KrebsforschungUniversità degli Studi di VeronaGovernment of OntarioAssociazione Italiana per la Ricerca sul CancroBundesministerium für Bildung und ForschungDeutsche ForschungsgemeinschaftEuropean Commission
Mots-clésPhenotypePancreatic cancerBiologyCancer researchMAPK/ERK pathwayCancer-Associated FibroblastsTumor microenvironmentAdenocarcinomaCancer cellCell biologyCancerSignal transductionGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Fibroblast heterogeneity is increasingly recognised across cancer conditions. Given their important contribution to disease progression, mapping fibroblasts’ heterogeneity is critical to devise effective anti-cancer therapies. Cancer-associated fibroblasts (CAFs) represent the most abundant cell population in pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC). Whether CAF phenotypes are differently specified by PDAC cell lineages remains to be elucidated. Here, we reveal an important role for the MAPK signalling pathway in defining PDAC CAF phenotypes. We show that epithelial MAPK activity promotes the myofibroblastic differentiation of CAFs by sustaining the expression and secretion of TGF-β1. We integrate single-cell profiling of post-perturbation transcriptional responses from mouse models with cellular and spatial profiles of human tissues to define a MAPKhigh CAF (mapCAF) phenotype. We show that this phenotype associates with basal-like tumour cells and reduced frequency of CD8+ T cells. In addition to elevated MAPK activity, this mapCAF phenotype is characterized by TGF-β signalling, hypoxia responsive signatures, and immunoregulatory gene programs. Furthermore, the mapCAF signature is enriched in myofibroblastic CAFs from various cancer conditions and correlates with reduced response to immune checkpoint inhibition in melanoma. Altogether, our data expand our knowledge on CAF phenotype heterogeneity and reveal a potential strategy for targeting myofibroblastic CAFs in vivo. Phenotypic and functional heterogeneity of cancer associated fibroblasts (CAFs) has been reported in pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC). Here the authors show that epithelial MAPK activity promotes myofibroblastic differentiation of CAFs. Furthermore, the epithelial basal-like subtype is associated with a CAF phenotype characterized by elevated MAPK activity and TGF-β signalling, associated with T cell exclusion in PDAC.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,044
Tête enseignante GPT0,386
Écart entre enseignants0,342 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations27
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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