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Enregistrement W4404961513 · doi:10.1021/acsestwater.4c01074

Suspended Solids and Optimal RNase Inhibitors Impact the Partitioning and Decay of SARS-CoV-2 in Wastewater

2024· article· en· W4404961513 sur OpenAlexafffundabout
Fernando Sanchez-Quete, Lawrence Chiang, Felipe Caldera Sequeira, Eyerusalem Goitom, Alexandra Tsitouras, Thomas Maere, Peter A. Vanrolleghem, Sarah Dorner, Dominic Frigon, Stephanie K. Loeb

Notice bibliographique

RevueACS ES&T Water · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSARS-CoV-2 detection and testing
Établissements canadiensUniversité LavalPolytechnique MontréalMcGill University
Organismes subventionnairesFonds de recherche du Québec – Nature et technologiesFondation familiale TrottierMolson FoundationMcGill University
Mots-clésWastewaterRNase PCoronavirusSevere acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2)Sewage treatmentDetection limitCoronavirus disease 2019 (COVID-19)VirologyVirusFecesExtraction (chemistry)ChemistryChromatographyBiologyMicrobiologyEnvironmental scienceRNAEnvironmental engineeringBiochemistryMedicineInternal medicineGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2), the virus causing COVID-19, can be monitored in wastewater due to its presence in human fecal matter. While wastewater surveillance programs for COVID-19 have already been implemented in many countries, fundamental questions remain regarding the distribution and decay of both SARS-CoV-2 and the common fecal indicator pepper mild mottle virus (PMMoV). In this study, for wastewater samples at 4 °C, the first-order decay rate constant ( k ) for a spiked coronavirus (HCoV 229E) was greater in mixtures with low TSS concentrations (0.373 ± 0.021 day –1 ) than in those with high concentrations (0.204 ± 0.014 day –1 ), which was consistent with measurements of the extended activity of RNases. Increasing the concentration of nontargeted and targeted RNase inhibitors revealed that the loss of the viral signal from the extraction is mainly due to the activity of RNA-degrading enzymes. A reanalysis of wastewater samples from Quebec City, Canada, with a 10× concentration of β-mercaptoethanol, a nontargeted RNase inhibitor, achieved an increase in SARS-CoV-2 and PMMoV concentrations. This investigation revealed further optimization avenues for improving the detection limit of SARS-CoV-2 in wastewater and enhancing the efficiency of wastewater surveillance programs, particularly in times of low viral prevalence.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,008
Score d'incertitude au seuil0,299

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,035
Tête enseignante GPT0,319
Écart entre enseignants0,284 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2024
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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