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Enregistrement W4404984352 · doi:10.1101/2024.11.29.626084

PD-L1 expression is mediated by microRNA processing, Wnt/β-catenin signaling, and chemotherapy in Wilms tumor

2024· preprint· en· W4404984352 sur OpenAlexaff
Kavita Desai, Patricia D.B. Tiburcio, Austin Warne, Arash Nabbi, Sean D. Reiff, Matthew Campbell, Kenneth Chen

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRenal and related cancers
Établissements canadiensPrincess Margaret Cancer CentreUniversity Health Network
Organismes subventionnairesUniversity of Texas MD Anderson Cancer CenterNational Cancer InstituteNational Institutes of HealthUniversity of Texas Southwestern Medical CenterAlex's Lemonade Stand Foundation for Childhood CancerU.S. Department of Defense
Mots-clésWilms' tumorWnt signaling pathwaymicroRNACancer researchChemotherapyExpression (computer science)Signal transductionMedicineBiologyInternal medicineCell biologyComputer scienceGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Inhibition of immune checkpoint proteins is effective in adult cancers but has shown limited efficacy in pediatric cancers. While factors regulating expression of immune checkpoint proteins such as PD-L1 are well-documented in adult cancers, their regulation is poorly understood in pediatric cancers. Here, we show that PD-L1 is upregulated in distinct subsets of Wilms tumor, the most common pediatric kidney cancer. Specifically, chemotherapy-exposed Wilms tumor specimens exhibited higher levels of PD-L1 expression, and common chemotherapeutics upregulated PD-L1 in childhood cancer cell lines in vitro . Furthermore, mutations in CTNNB1 and DROSHA , the two most commonly mutated genes in Wilms tumor, correlated with higher PD-L1. Activation of Wnt/β-catenin signaling and knockdown of DROSHA or DICER1 both increase PD-L1 in vitro . Lastly, in adult cancers, DICER1 alterations are associated with immune gene expression signatures and improved survival in response to immune checkpoint inhibitors. Together, our results identify clinical and biological properties regulating PD-L1 in Wilms tumor that may inform precision therapy approaches in pediatric immuno-oncology.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,208
Écart entre enseignants0,203 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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