Inversions contribute disproportionately to parallel genomic divergence in dune sunflowers
Notice bibliographique
Résumé
The probability of parallel genetic evolution is a function of the strength of selection and constraints imposed by genetic architecture. Inversions capture locally adapted alleles and suppress recombination between them, which limits the range of adaptive responses. In addition, the combined phenotypic effect of alleles within inversions is likely to be greater than that of individual alleles; this should further increase the contributions of inversions to parallel evolution. We tested the hypothesis that inversions contribute disproportionately to parallel genetic evolution in independent dune ecotypes of Helianthus petiolaris. We analysed habitat data and identified variables underlying parallel habitat shifts. Genotype-environment association analyses of these variables indicated parallel responses of inversions to shared selective pressures. We also confirmed larger seed size across the dunes and performed quantitative trait locus mapping with multiple crosses. Quantitative trait loci shared between locations fell into inversions more than expected by chance. We used whole-genome sequencing data to identify selective sweeps in the dune ecotypes and found that the majority of shared swept regions were found within inversions. Phylogenetic analyses of shared regions indicated that within inversions, the same allele typically was found in the dune habitat at both sites. These results confirm predictions that inversions drive parallel divergence in the dune ecotypes.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».