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Enregistrement W4405009752 · doi:10.3354/ame02014

The hypersaline northwestern Arabian Gulf contains a phylogenetically diverse and highly uneven community of viruses related to cyanophages and pelagiphages

2024· article· en· W4405009752 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueAquatic Microbial Ecology · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEvolution and Genetic Dynamics
Établissements canadiensUniversity of British ColumbiaFisheries and Oceans Canada
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésOceanographyBiologyEcologyGeographyGeology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cyanobacteria are the dominant primary producers in many marine waters, and are intimately connected with the cyanophages that infect them. The most commonly isolated marine cyanophages form a monophyletic group based on several marker genes including g20, a gene that codes the capsid assembly protein. Based on morphology, these viruses are typically referred to as cyanomyoviruses. Here, we used g20 sequences to interrogate the diversity of cyanomyoviruses at 5 locations in the waters of the northwestern Arabian Gulf. The diversity and richness of g20 sequences varied among locations and were highest at the southernmost sites. Most sequences belonged to a small number of operational taxonomic units (OTUs), with the rest belonging to low abundance rare OTUs. Phylogenetic analysis revealed that the most abundant genotypes fell within the ubiquitous cyanomyovirus Cluster II, while others clustered with metagenome assembled pelagimyophage sequences and other environmental sequences across a broad diversity of clades. This study revealed a diverse community of cyanomyoviruses in the northwestern Arabian Gulf that is dominated by a few relatively abundant but phylogenetically diverse taxa.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,835
Score d'incertitude au seuil0,725

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,252
Écart entre enseignants0,244 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle