Factors associated with disease in farmed and wild salmonids caused by Tenacibaculum maritimum: a scoping review
Notice bibliographique
Résumé
Introduction Yellow mouth disease, caused by Tenacibaculum maritimum, is an important disease of farmed salmonids. Disease management currently necessitates the use of antimicrobials, raising concerns about antimicrobial resistance (AMR) in aquatic and potentially terrestrial environments. Identifying management, production, environmental, and other factors associated with the development of yellow mouth in salmonids will help to elucidate disease control strategies and decrease the economic and environmental burden of its treatment. The objective of this scoping review was to synthesize the available literature to identify factors associated with disease in farmed and wild salmonids from T. maritimum. Methods The scoping review followed the framework outlined in the Joanna Briggs Institute Reviewer’s Manual and PRSIMA-ScR reporting guidelines. The protocol was developed a priori in consultation with a librarian and was used to search Environment Complete®, Earth, Atmospheric, and Aquatic Science®, Scopus®, and Web of Science™ databases on July 21, 2022, and again on April 27, 2023. Articles were included if they focused on T. maritimum infection in salmonids and discussed factors (environmental, management, or other) that impacted the disease and/or organism of interest. Results Twenty-five articles were included for review. Over half were published within the last five years (n=14/25). The included articles revealed a complex interplay of salmonid (host)-specific factors (age/size), management practices (vaccination, marine transfer, stocking density, gill/body abrasion), environmental conditions (water temperature, oxygenation, salinity, algal blooms, vectors), and microbial dynamics (load, co-infections, strain, biofilms, microbiome) influencing T. maritimum infections. Only one study conducted multivariable analysis to understand this complex interplay between the diverse factors that impact infection with T. maritimum. Discussion The review highlights the complex, multifactorial nature of T. maritimum infections, including the interplay of host biology, environmental factors, and pathogen characteristics. A comprehensive approach incorporating both management and environmental components is essential to mitigate T. maritimum infections in salmonid production.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,011 | 0,052 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,005 | 0,006 |
| Bibliométrie | 0,017 | 0,016 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,004 | 0,003 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,002 |
| Intégrité de la recherche | 0,003 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,005 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».