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Enregistrement W4405035632 · doi:10.48550/arxiv.2412.01953

The Landscape of Causal Discovery Data: Grounding Causal Discovery in Real-World Applications

2024· preprint· en· W4405035632 sur OpenAlexfundno aff
Philippe Brouillard, Chandler Squires, Jonas Wahl, Konrad P. Körding, Karen Sachs, Alexandre Drouin, Dhanya Sridhar

Notice bibliographique

RevuearXiv (Cornell University) · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineDecision Sciences
ThématiqueData Quality and Management
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of Mental HealthBundesministerium für Bildung und ForschungNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institute for Advanced Research
Mots-clésData scienceData discoveryComputer scienceGeographyWorld Wide Web

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Causal discovery aims to automatically uncover causal relationships from data, a capability with significant potential across many scientific disciplines. However, its real-world applications remain limited. Current methods often rely on unrealistic assumptions and are evaluated only on simple synthetic toy datasets, often with inadequate evaluation metrics. In this paper, we substantiate these claims by performing a systematic review of the recent causal discovery literature. We present applications in biology, neuroscience, and Earth sciences - fields where causal discovery holds promise for addressing key challenges. We highlight available simulated and real-world datasets from these domains and discuss common assumption violations that have spurred the development of new methods. Our goal is to encourage the community to adopt better evaluation practices by utilizing realistic datasets and more adequate metrics.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,225
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,614
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesMétarecherche
DomaineSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,775
Score d'incertitude au seuil0,956

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,2250,614
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,002
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,003
Bibliométrie0,0180,019
Études des sciences et des technologies0,0030,019
Communication savante0,0150,025
Science ouverte0,0070,008
Intégrité de la recherche0,0070,010
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,281
Tête enseignante GPT0,333
Écart entre enseignants0,052 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; l’étiquette directe de Gemma et le classifieur distillé Codex s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeObservationnel
DomaineMéthodes
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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