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Enregistrement W4405042362 · doi:10.1182/blood-2024-205920

Single Cell Profiling of Hematopoietic Stem and Progenitor Cells in Pediatric Acquired Aplastic Anemia

2024· article· en· W4405042362 sur OpenAlexaff
Derek Chan, Meltem E. Omur, Diana Lin, Wyeth W. Wasserman, Aly Karsan, Suzanne Vercauteren

Notice bibliographique

RevueBlood · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueErythrocyte Function and Pathophysiology
Établissements canadiensUniversity of British ColumbiaCanada's Michael Smith Genome Sciences CentreHospital for Sick ChildrenBC Children's HospitalUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAplastic anemiaHaematopoiesisProgenitor cellStem cellImmunologyMedicineHematopoietic stem cell transplantationBiologyBone marrowCell biology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Acquired severe aplastic anemia (AA) is a bone marrow failure disorder featuring a paucity of blood cells that significantly predisposes affected individuals to life threatening infections and/or bleeding, evolution to myelodysplastic syndrome/leukemia, risk of treatment relapse and/or death. The latest successful addition of Eltrombopag, a unique thrombopoietin receptor agonist, to frontline immunosuppressive therapy among adult patients with acquired AA has provided proof-of-principle that there may be additional ways to recover hematopoiesis in this setting. To examine the causes of and to identify novel strategies to rescue haematopoiesis in pediatric AA, we employed single cell profiling using cellular indexing of transcriptomes and epitopes (CITE-seq) on lineage-negative and treatment-naïve diagnostic severe paediatric AA (n = 5) and age-approximated healthy donor (n = 4) primary bone marrow samples and obtained transcriptomes of 2,009 and 13,861 single cells respectively. This profiling uncovered a widespread loss of primitive hematopoietic stem and progenitor cells (HSPCs) in pediatric AA with significant enrichment for IFN-γ, IL6/JAK/STAT, unfolded protein response and PI3K/AKT/MTOR pathways. Residual HSCs in pediatric AA showed enrichment of a recently described HSC inflammatory memory transcriptional signature. Granzymes were distinctly upregulated in residual HSPCs within pediatric AA. Further profiling of additional samples is required to capture additional events among rare HSPC populations. Altogether, these results demonstrate significant underlying inflammation and rationalize testing of Ruxolitinib, Sirolimus and granzyme blockade in pediatric AA. Future work will involve establishing a bone marrow organoid model of pediatric AA for therapeutic screening and drug discovery.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,014
Score d'incertitude au seuil0,344

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,228
Écart entre enseignants0,213 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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