Single Cell Profiling of Hematopoietic Stem and Progenitor Cells in Pediatric Acquired Aplastic Anemia
Notice bibliographique
Résumé
Acquired severe aplastic anemia (AA) is a bone marrow failure disorder featuring a paucity of blood cells that significantly predisposes affected individuals to life threatening infections and/or bleeding, evolution to myelodysplastic syndrome/leukemia, risk of treatment relapse and/or death. The latest successful addition of Eltrombopag, a unique thrombopoietin receptor agonist, to frontline immunosuppressive therapy among adult patients with acquired AA has provided proof-of-principle that there may be additional ways to recover hematopoiesis in this setting. To examine the causes of and to identify novel strategies to rescue haematopoiesis in pediatric AA, we employed single cell profiling using cellular indexing of transcriptomes and epitopes (CITE-seq) on lineage-negative and treatment-naïve diagnostic severe paediatric AA (n = 5) and age-approximated healthy donor (n = 4) primary bone marrow samples and obtained transcriptomes of 2,009 and 13,861 single cells respectively. This profiling uncovered a widespread loss of primitive hematopoietic stem and progenitor cells (HSPCs) in pediatric AA with significant enrichment for IFN-γ, IL6/JAK/STAT, unfolded protein response and PI3K/AKT/MTOR pathways. Residual HSCs in pediatric AA showed enrichment of a recently described HSC inflammatory memory transcriptional signature. Granzymes were distinctly upregulated in residual HSPCs within pediatric AA. Further profiling of additional samples is required to capture additional events among rare HSPC populations. Altogether, these results demonstrate significant underlying inflammation and rationalize testing of Ruxolitinib, Sirolimus and granzyme blockade in pediatric AA. Future work will involve establishing a bone marrow organoid model of pediatric AA for therapeutic screening and drug discovery.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».