UBE2E3 Supports Survival of Leukemia Stem Cells By Regulation of Polycomb Repression Complex (PRC) 1.1
Notice bibliographique
Résumé
AML cells are arranged in a hierarchy with leukemia stem cells giving rise to a more differentiated bulk leukemia cells. The determinants that support stemness are still not completely understood. Recently, we identified importin 11 (IPO11), a nuclear transport receptor, as a regulator of stemness in AML. To identify cargo protein imported into the nucleus by IPO11, we conducted a BioID-mass spectrometry screen. Through this screen, we discovered that IPO11 interacts with the E2 ligase, UBE2E3 to regulate its nuclear localization. The importance of UBE2E3 in AML and its role in leukemia stemness is currently unknown. Therefore, we focused our investigation on UBE2E3. To understand the role of UBE2E3 in AML and leukemia stem cells, we knocked down UBE2E3 in AML cell lines. Silencing of UBE2E3 shifted the transcriptomic signature away from leukemia stem cells and hematopoietic stem cell progenitors toward a more differentiated and mature signature: LSC+ vs. LSC- (FDR ≤0.01, GSE76008) and progenitor/stem vs. myeloid cluster (FDR ≤ 0.01, TCGA-AML). Moreover, knockdown of UBE2E3 in OCI-AML2, NB4 and K562 AML cells reduced growth and viability of by 60-70%, as well as reduced clonogenic growth, consistent with an effect on leukemia initiating cells. To investigate how UBE2E3 regulates leukemic stemness, we performed a BioID mass spectrometry screen for proteins that interact with UBE2E3. Through this screen, we discovered that UBE2E3 interacted with poly-comb repression complex (PRC) proteins, including four core components of a variant of PRC-1, designated PRC1.1, KDM2B, BCOR, RING1 and PCGF1. The PRC mediates epigenetic transcriptional repression, governing key cellular processes, including proliferation and differentiation. Previous work has shown that PRC1.1 control specific genes required for leukemic cell viability. Knockdown of UBE2E3 decreased expression of known PRC 1.1 target genes specific for AML (FDR ≤0.01, GSE54580), such as PKM, MAP3K6 and ERCC1, demonstrating that UBE2E3 positively regulates PRC1.1 activity. In summary, we identified UBE2E3 as a novel regulator of non-canonical PRC 1.1 complex in AML and through that mechanism a positive regulator of leukemia stemness. Thus, we identified UBE2E3 as a possible novel target in AML.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».