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Enregistrement W4405056467 · doi:10.1101/2024.11.30.626187

Intraspecific differences in alkaline tolerance in brook stickleback ( <i>Culaea inconstans</i> ) inhabiting neutral and alkaline lakes

2024· preprint· en· W4405056467 sur OpenAlexaffabout
Alex M. Zimmer, Marina Giacomin, Anne‐Marie Dion‐Côté, Greg G. Goss, Chris N. Glover

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiquePhysiological and biochemical adaptations
Établissements canadiensGeoscience BCAthabasca UniversityUniversité de MonctonSaint John Regional HospitalUniversity of AlbertaUniversity of New Brunswick
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSticklebackIntraspecific competitionBiologyEcologyZoologyFish <Actinopterygii>Fishery

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Exposure to alkaline water (pH > 9.0) is physiologically challenging for fish, yet our understanding of the physiology of alkaline tolerance in fishes is limited to a small number of ihighly specialized species. This study aimed to characterize mechanisms of alkaline tolerance in brook stickleback ( Culaea inconstans ), a fish species with a broad pH habitat range, including highly alkaline waters such as Buffalo Lake (pH = 9.2) in Alberta, Canada. Stickleback from Buffalo Lake and a neutral reference lake (Buck Lake; pH = 8.2) were collected from the wild and acclimated to common conditions (pH = 8.0) for at least 2 months. Both populations were then exposed to alkaline conditions (pH = 9.5), resulting in a significant decrease in survival (14% by 7 d of exposure) in Buck Lake fish, but no mortality in Buffalo Lake stickleback. In a 4-d exposure to alkaline water, fish from both populations experienced characteristic inhibitions of ammonia excretion followed by subsequent recovery, in conjunction with an accumulation of ammonia within the body. However, no differences were observed between populations. Analysis of tissue Na + and Cl - content showed a more pronounced decrease in Cl - in Buck Lake fish, suggesting that tighter regulation of Cl - homeostasis and/or acid-base balance may be an important feature of alkaline tolerance. RNA-sequencing analysis highlighted large differences in gene expression between the alkaline and neutral lake populations, and in response to alkaline exposure. Few of these changes in the expression involved genes known to be associated with nitrogen, ion, or acid-base balance. These data indicate that alkaline tolerance is higher in brook stickleback resident to an alkaline lake than those sourced from a neutral lake, a trait that may be related to differences in physiological and transcriptomic responses to alkaline exposure.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,029
Score d'incertitude au seuil0,058

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,204
Écart entre enseignants0,190 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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