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Enregistrement W4405060066 · doi:10.22456/1679-9216.140400

Degenerative Myelopathy in Brazilian Golden Retriever: Evaluation of the Association with Allele Frequency of the SOD1:c.118G>A Variant

2024· article· en· W4405060066 sur OpenAlexaboutno aff
F. Ito, Lukas Garrido Albertino, Fabiana Michelsen de Andrade, Alexandre Secorun Borges, José P. Oliveira‐Filho

Notice bibliographique

RevueACTA SCIENTIAE VETERINARIAE · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueNeurogenetic and Muscular Disorders Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSOD1MyelopathyMedicineAllelePathologyLabrador RetrieverSpinal cordAmyotrophic lateral sclerosisGeneticsBiologyDiseaseGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Canine degenerative myelopathy represents a progressive neurodegenerative disorder impacting the spinal cord. Initial clinical signs of canine degenerative myelopathy are typically observed in animals around 8 years of age. The clinical signs are characterized by general proprioceptive ataxia and spastic paresis of the pelvic limbs, with an irrepressible progression to flaccid paraplegia after 1 year of the appearance of the signs. Therefore, canine degenerative myelopathy is considered a differential diagnosis for medullary neoplasms, disc protrusion, and hip dysplasia, and since the clinical signs presented by the animals are similar in all these diseases, genetic testing plays an important role in diagnosis. In several dog breeds degenerative myelopathy was linked to the c.118G>A autosomal recessive variant in exon 2 of the superoxide dismutase 1 (SOD1) gene (SOD1:c.118G>A). In addition, the SOD1:c.118G>A variant in more than 124 breed dogs, suggesting that this variant is widely spread and fixed in the species before the breeds’ origin. However, there are few studies evaluating this variant in brazilian dogs, and none of them have evaluated it in the Brazilian Golden Retriever dogs. Therefore, this study aimed to evaluate the allele frequency of the SOD1:c.118G>A variant in Golden Retriever dogs from Brazilian kennels. Materials, Methods & Results: A total of 122 Brazilian Golden Retriever DNA samples were used in a PCR procedures with specific primers, previously described, to amplify a 779 base pairs amplicon containing the SOD1:c.118G>A variant in this study. a non-template control reaction was performed to check possible contamination in the PCR preparation. The genotyping of the animals was performed by direct Sanger sequencing of PCR products that amplified a fragment containing the variant. Considering the 95% confidence interval, the sample size used in the present study was slightly larger than the minimum required to assess the allele frequency of SOD1:c.118G>A variant (122 versus 113 samples). All animals assessed in this study were clinically normal at the time of sampling and were identified as wild-type for the SOD1:c.118G>A variant. Therefore, no alleles of the pathogenic variant (A) were found in the studied population. Discussion: Although all animals assessed in this study were classified as wild-type, this study is the 1st report in Brazil to evaluate the prevalence of this variant in Golden Retriever dogs. The poor prognosis and inexorable progression of canine degenerative myelopathy force most owners to opt for early euthanasia of affected animals. Knowledge of the disease by owners and breeders, as well as the genotyping of their animals, may prevent the spread of the variant among lineages and also assist veterinarians in differential diagnosis and management of cases of canine degenerative myelopathy. The genetics of Brazilian Golden Retriever were mainly derived from USA bloodlines. With this in mind, we may speculate that the results observed in this study may be influenced by the lower prevalence of the SOD1:c.118G>A variant previously found in American Golden Retrievers. The results obtained in the present study, combined with previous studies that described the occurrence of this variant as rare in Golden Retrievers, lead us to speculate that this variant does not impact the Brazilian Golden Retriever dogs. Keywords: dogs, canine degenerative myelopathy (CDM), neurodegenerative disease, genotyping, SOD1, variants.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,825
Score d'incertitude au seuil0,263

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,299
Écart entre enseignants0,275 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
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