Analysis of the Cultured Microbiome of Fertilization-Stage Maize Silks (Styles) Reveals Taxonomic Relationships Across North American Maize Genotypes and Heterotic Groups
Notice bibliographique
Résumé
The style is the female reproductive channel in flowers, receiving pollen and transmitting male gametes through elongating pollen tubes to the ovules during fertilization. In maize/corn, the styles are known as silks. Fertilization-stage silks contain diverse bacteria, possibly originating from pollen. Bacteria were cultured and individually sequenced from the tip and base portions of healthy, fertilization-stage silks of 14 North American maize genotypes, resulting in 350 isolates, spanning 48 genera and 221 OTUs. The objective of this study was to taxonomically analyze these bacteria in the context of the maize host tissue and genotype, taking advantage of long-read (V1–V9) 16S Sanger sequencing. The results suggest that the maize genotype and heterotic breeding group may impact the bacterial diversity of healthy, fertilization-stage silks. Some taxa were relatively conserved across maize genotypes and silk tip/base locations, including Pantoea, which may represent part of the core microbiome or form stable, symbiotic relationships with healthy, pollinated silks. We also observed similarities between the silk microbiomes of maize genotypes that were related by plant pedigree; these preliminary results suggest inheritance or the ability of related genotypes to recruit common bacterial taxa. Overall, this study demonstrates that healthy maize silks represent a valuable resource for learning about relationships between plant reproductive microbiomes.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».