Patient-responsive protein biomarkers for cartilage degeneration and repair identified in the infrapatellar fat pad
Notice bibliographique
Résumé
OBJECTIVES: Cartilage defects (CDs) are regarded as early manifestation of osteoarthritis (OA). The infrapatellar fat pad (IPFP) is an important mediator in maintaining joint homeostasis, disease progression and tissue repair, with a crucial role of its secreted proteins. Here, we investigate the proteome of the IPFP in relation to clinical status and response to surgical treatment of CDs. METHODS: In order to characterize the proteome of the IPFP, samples from a cohort of 53 patients who received surgical treatment for knee CDs were analyzed with label-free proteomics. Patients were divided based on validated outcome scores for pain and knee function, preoperatively and at 1-year postoperatively, and on MRI assessment of the defect severity, fibrosis and synovitis. RESULTS: Specific proteins were differentially abundant in patients with MRI features and better clinical outcome after CD surgery, including a downregulation of cartilage intermediate layer protein 2 (CILP-2) and microsomal glutathione s-transferase 1 (MGST1), and an upregulation of aggrecan (ACAN), and proteoglycan 4 (PRG4). Pathways related to cell interaction, oxidation and matrix remodeling were altered. CONCLUSION: Proteins in the IPFP that have a function in extracellular matrix, inflammation and immunomodulation were identified as potentially relevant markers for cartilage repair monitoring.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».