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Enregistrement W4405107102 · doi:10.1021/acs.jmedchem.4c01995

Structure-Based Discovery of a Series of Covalent, Orally Bioavailable, and Selective BFL1 Inhibitors

2024· article· en· W4405107102 sur OpenAlexaff
Adeline Palisse, Tony Cheung, Thomas J. Cogswell, Bruna S. Martins, Rick Riemens, Giovanni Battocchio, Chimed Jansen, M.A. Cottee, Kimberly J. Ornell, Claudia Sacchetto, Leonardo J. Leon, Maaike van Hoek- Emmelot, Mark J. Bostock, Brooke L. Brauer, Kevin Beaumont, Simon C. C. Lucas, Samiyah Ahmed, J. Henry Blackwell, Ulf Börjesson, Andrea Gohlke, Iva Monique T. Gramatikov, David Hargreaves, Vera van Hoeven, Vasudev Kantae, Lea Kupcova, Alexander G. Milbradt, Uthpala Seneviratne, Nancy Su, John Vales, Haiyun Wang, M. J. D. White, Olaf Kinzel

Notice bibliographique

RevueJournal of Medicinal Chemistry · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCell death mechanisms and regulation
Établissements canadiensDiscovery Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésChemistryIn vivoCovalent bondLead compoundEnzymeStructure–activity relationshipProgrammed cell deathCaspaseIn vitroBioavailabilityComputational biologyBiochemistryApoptosisPharmacologyGeneticsBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BFL1, a member of the antiapoptotic BCL2 family, has been relatively understudied compared to its counterparts despite evidence of its overexpression in various hematological malignancies. Across two articles, we describe the development of BFL1 in vivo tools. The first article describes the hit identification from a covalent fragment library and the subsequent evolution from the hit to compound 6 . 22 This work reports the structure-based optimization of compound 6 into a series of BFL1 inhibitors selective over the other BCL2 family members, with low nanomolar cellular activity when combined with AZD5991, exemplified by compound 20 . Compound 20 demonstrated a cell death phenotype in SUDHL1 and OCILY10 cell lines and in the in vivo study, BFL1 stabilization and cleaved caspase 3 activation were observed in a dose-dependent manner. In addition, the enzymatic turnover studies with the BFL1 protein showed that compound 20 stabilized the protein, extending the half-life to 10.8 h.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,221
Écart entre enseignants0,216 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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