Comparative genomics of <i>Rickettsiella</i> bacteria reveal variable metabolic pathways potentially involved in symbiotic interactions with arthropods
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Members of the Rickettsiella genus (order: Legionellales ) are emerging as widespread bacteria associated with insects, arachnids, and crustaceans. While some Rickettsiella strains are highly virulent pathogens, others are maternally inherited endosymbionts that manipulate arthropod phenotypes, including the induction of defensive symbiosis and cytoplasmic incompatibility. However, the genomic diversity of Rickettsiella remains largely unexplored, and their genetic potential to induce complex phenotypes in arthropods is only partially understood. In this study, we sequenced five new Rickettsiella genomes isolated from three tick species. Through comparative genomics, we observed that Rickettsiella members share similar metabolic capabilities, and collectively lack virulence genes from pathogenic Legionellales. Additional analysis of Rickettsiella genomes revealed significant variability in metabolic properties related to endosymbiosis. Specifically, their capacity to biosynthesize certain B vitamins and heme varies, suggesting a functional role of some Rickettsiella strains in the nutrition of their arthropod hosts. Some Rickettsiella genomes harbour homologs of Wolbachia cif genes, the cause of Wolbachia -induced cytoplasmic incompatibility,, suggesting that Rickettsiella may use a similar molecular mechanism to manipulate the reproduction of their arthropod hosts. Phylogenomics further revealed that tick-borne Rickettsiella exhibit distinct evolutionary origins within the genus, indicating that Rickettsiella have undergone repeated horizontal transfers between ticks and other arthropods.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».