Bartonella quintana Infection in Canada: A Retrospective Laboratory Study and Systematic Review of the Literature
Notice bibliographique
Résumé
Background:Bartonella quintana is a body-louse-borne bacterium. Canadian B. quintana disease has been reported primarily in populations experiencing homelessness and in Indigenous communities with limited access to water. We sought to understand the epidemiology of B. quintana in Canada. Methods: This study combined an analysis of laboratory data from Canada’s National Microbiology Laboratory (NML) with a systematic review of the literature. Laboratory data included quantitative polymerase chain reaction (qPCR) cycle threshold values and indirect immunofluorescent antibody titers with the year and province of the sample acquisition. For the systematic review, we searched PubMed, Scopus, Embase, and Web of Science for articles published before 15 July 2024, with terms related to B. quintana in Canada. Results: Thirty-three individuals with qPCR-positive B. quintana were documented in seven provinces and one territory. The number of cases increased over time (p-value = 0.005), with the greatest number of cases being reported in 2022 and 2023. The percent positivity for the B. quintana qPCR performed at the NML increased over time (p-value = 0.036). The median immunoglobulin G titer demonstrated a sustained increase starting in 2017. The systematic review identified fourteen individuals with qPCR-positive B. quintana (none had a qPCR performed at the NML) and seven probable cases of B. quintana disease. Four of these twenty-one individuals from the systematic review died (19%). All fatalities were attributed to endocarditis. Conclusions: The detection of B. quintana disease in seven provinces and one territory suggests that B. quintana has a national distribution. B. quintana disease is increasingly diagnosed in Canada, indicating ongoing transmission across geographic settings.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,004 | 0,020 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,004 | 0,002 |
| Bibliométrie | 0,021 | 0,030 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,002 |
| Communication savante | 0,003 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».