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Enregistrement W4405133589 · doi:10.1101/2024.12.04.626782

A feline model of human LDLR-related atherosclerosis

2024· preprint· en· W4405133589 sur OpenAlexaff
Marjo K. Hytönen, Veera Karkamo, Sruthi Hundi, Niina Airas, Maria Kaukonen, Antti Sukura, Leslie A. Lyons, Ilona Kareinen, Hannes Lohi

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueAtherosclerosis and Cardiovascular Diseases
Établissements canadiensMaRS
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésLDL receptorBusinessInternal medicineMedicineCholesterolLipoprotein

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Atherosclerosis, a chronic inflammatory vascular disease driven by the accumulation of LDL-derived cholesterol on arterial walls, is the leading cause of mortality worldwide but is rare in animals. We recently identified spontaneous atherosclerosis in the Korat cat breed, characterized by severe hypercholesterolemia and clinical signs of congestive heart failure, ultimately leading to death. Histopathological examination revealed lesions similar to those observed in human atherosclerosis. Given the close genetic relationship among affected cats, we hypothesized a genetic basis for the condition. Methods: We expanded our sample recruitment and employed whole genome sequencing to identify genetic variants associated with the condition. Results: We identified a homozygous XM_003981898.6:c.2406G>A variant specific to the cases in the LDLR gene. This variant is predicted to result in a premature stop codon, XP_003981947.3:p.Trp758*, leading to a truncated LDLR protein that lacks the last 108 amino acids, including the transmembrane and intracellular C-terminal domains. Genotyping this LDLR variant in an additional cohort of 309 Korat cats confirmed its segregation and revealed new affected cats for clinical follow-up. In silico analyses demonstrated that the identified variant appears optimal for gene-editing-based therapeutics. Conclusions: This is the first report of a spontaneous atherosclerosis animal model with an LDLR variant, the most common gene associated with familial hypercholesterolemia in humans. Given that PCSK9, another known hypercholesterolemia gene, has been lost in many mammalian genomes, including cats, our study provides an exciting double knockout model for human atherosclerosis. The affected Korats may also serve as a valuable model for DNA base editing therapeutics.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,021

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0060,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,219
Écart entre enseignants0,200 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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