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Enregistrement W4405137465 · doi:10.1016/j.diagmicrobio.2024.116646

Clinical utility of PCR compared to conventional culture and sensitivity testing for management of complicated urinary tract infections in adults: Part II.Evaluation of diagnostic concordance, discordant results, and antimicrobial selection efficacy

2024· article· en· W4405137465 sur OpenAlexaff
Frank L Spangler, Cheau Williams, Michael Aberger, Khaled Ajib, Shahram S. Gholami, H. Goodwin, Lauren Park, Moustafa Kardjadj, DeAndre Derrick, Thomas K. Huard

Notice bibliographique

RevueDiagnostic Microbiology and Infectious Disease · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueUrinary Tract Infections Management
Établissements canadiensCanadian Association for Co-operative Education
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésConcordanceUrinary systemMedicineAntimicrobialSelection (genetic algorithm)Intensive care medicineInternal medicineBiologyMicrobiologyComputer scienceMachine learning

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

PURPOSE: Complicated urinary tract infections (cUTIs) are difficult to manage due to their polymicrobial nature and resistance to standard therapies. In current clinical practice, the management of a cUTI often starts with broad-spectrum antimicrobials until culture and sensitivity (C&S) results are available, but these diagnostic delays further hinder treatment efficacy. Polymerase Chain Reaction (PCR) offers a faster alternative. This study evaluates PCR's utility compared to C&S, focusing on agreeability, discordant results, clinical outcomes, and antimicrobial selection efficacy to improve cUTI management. MATERIALS AND METHODS: The clinical study was conducted in two parts: the primary study focused on patients with cUTIs, while the sub-study involved healthy individuals without signs or symptoms of urinary tract infection (UTI). All collected samples underwent analysis using both PCR and C&S for comparison. Building on the first part of the study, the research evaluated outcome measures related to discordant analysis. RESULTS: Overall, our study supports good agreement between PCR and C&S in positive cases (95.32 % at baseline and 88.06 % at end of study (EOS)) but reveals some discordance in negative cases (38.30 % at baseline and 62.91 % at EOS). The negative percent agreement (NPA) in the sub-study on the healthy population was 70.16 %. Further analysis of discordant results revealed that symptomatic patients treated for PCR-positive infections trended toward better clinical outcomes (77.45 % vs. 71.42 %) and higher rates of microbiological eradication (53.92 % vs. 50 %) compared to those treated for C&S-positive infections. Additional analysis on antimicrobial use and microbiological aspects revealed that the PCR group received more oral medication-based treatments, while the C&S group received other forms (intramuscular or bladder irrigation). In cases of discordant results, there were more PCR-positive but culture-negative cases than PCR-negative but culture-positive cases. CONCLUSIONS: Our clinical utility study data suggests that PCR-guided management of cUTIs is overall superior to conventional C&S, offering several advantages. PCR has the potential to enhance patient care by enabling the early adoption of narrower antibiotic therapies, improving clinical outcomes, and ensuring the effective selection of antimicrobials. A PCR-guided management plan could be particularly beneficial in managing patients with cUTIs, addressing infections that are occasionally overlooked with current C&S-guided treatment protocols.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,013
Score d'incertitude au seuil0,800

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,037
Tête enseignante GPT0,338
Écart entre enseignants0,301 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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