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Enregistrement W4405172472 · doi:10.1186/s44263-024-00105-x

Unveiling pandemic patterns: a detailed analysis of transmission and severity parameters across four COVID-19 waves in Bogotá, Colombia

2024· article· en· W4405172472 sur OpenAlexfundno aff
David Santiago Quevedo, Diego de Miguel‐Pérez, Maria Alejandra Cabrera Polanía, Juan David Serrano Medina, Felipe Segundo Abril-Bermúdez, Diane Moyano Romero, Diana Sofía Ríos Oliveros, M. Mayorga, Charles A. Whittaker, Zulma M. Cucunubá

Notice bibliographique

RevueBMC Global and Public Health · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMathematics
ThématiqueCOVID-19 epidemiological studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesInternational Development Research CentreWellcome Trust
Mots-clésCoronavirus disease 2019 (COVID-19)Pandemic2019-20 coronavirus outbreakSevere acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2)Transmission (telecommunications)GeographyVirologyMedicineComputer scienceOutbreakTelecommunicationsInfectious disease (medical specialty)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Despite a wealth of data from high-income countries, there is limited information on the distinct epidemiological patterns observed in diverse, densely populated regions within Latin America. This retrospective analysis of COVID-19's four major waves in Bogotá, Colombia, evaluates 1.77 million cases in detail. METHODS: , while variant-specific transmission advantages were estimated using multinomial logistic regression models. Disease severity was assessed through a suite of indicators: Hospitalisation Case Ratio (HCR), intensive care unit case ratio (ICU-CR), case fatality ratio (CFR), hospitalisation fatality ratio (HFR), and ICU fatality ratio (ICU-FR). Additionally, we analysed the distribution of hospitalisations, ICU admissions, and fatalities by age group and wave. We employed a Bayesian hierarchical model to capture epidemiological delays-such as onset-to-death, hospitalisation, and ICU admission durations to estimate hospital and ICU stay durations. RESULTS: , with peaks exceeding 2.5 during the ancestral and Omicron waves. Over the course of the pandemic, we observed a 78% reduction in CFR, underscoring shifts in clinical severity. The third wave, associated with the Mu variant, recorded the highest case and death counts, alongside a decreased CFR, an elevated HFR, and a shift in the most affected age group towards younger populations. In contrast, the fourth wave, driven by the Omicron variant, exhibited the highest reproduction number and the lowest overall severity. This wave was characterised by a significant increase in pediatric hospitalisations. The study reveals a continued decline in the mean durations of hospital and ICU stays across the four waves, with hospital stays decreasing from 10.84 to 7.85 days and ICU stays dropping from 16.2 to 12.4 days. CONCLUSIONS: This study reveals significant shifts in transmission and severity metrics-including mortality, hospitalisation, and ICU rates and stays-across age groups during Bogotá's four COVID-19 waves. These insights underscore the value of retrospective analyses to understand the pandemic's varied impact and inform public health strategies in diverse urban settings.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,004
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,041
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0040,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,334
Tête enseignante GPT0,473
Écart entre enseignants0,139 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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