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Enregistrement W4405175789 · doi:10.1016/j.isci.2024.111518

Roles for the long non-coding RNA Pax6os1/PAX6-AS1 in pancreatic beta cell function

2024· article· en· W4405175789 sur OpenAlexafffund
Livia López–Noriega, Rebecca Callingham, Aida Martínez-Sánchez, Sameena Nawaz, Grazia Pizza, Nejc Haberman, Nevena Cvetešić, Marie‐Sophie Nguyen‐Tu, Boris Lenhard, Piero Marchetti, Lorenzo Piemonti, Eelco J.P. de Koning, A. M. James Shapiro, Paul Johnson, Isabelle Leclerc, Benoît Hastoy, Benoit R. Gauthier, Timothy J. Pullen, Guy A. Rutter

Notice bibliographique

RevueiScience · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer-related molecular mechanisms research
Établissements canadiensUniversité de MontréalMcGill University Health CentreUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesBreakthrough T1D CanadaDivision of Diabetes, Endocrinology, and Metabolic DiseasesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesHorizon 2020Spanish National Plan for Scientific and Technical Research and InnovationWellcome TrustBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilMedical Research CouncilFaculty of Science and Engineering, University of ManchesterHorizon 2020 Framework ProgrammeNational Institutes of HealthJuvenile Diabetes Research Foundation United KingdomJuvenile Diabetes Research Foundation InternationalDiabetes UKCanadian Institutes of Health ResearchInnovative Medicines InitiativeEuropean Regional Development FundMinisterio de Ciencia e InnovaciónUniversity of AlbertaEuropean CommissionUniversity of the EastDiabetes Research and Wellness FoundationStichting Diabetes Onderzoek NederlandDiabetes FondsAgencia Estatal de InvestigaciónBontius Stichting
Mots-clésPAX6Function (biology)Coding (social sciences)RNAComputational biologyChemistryBiologyCell biologyBiochemistryGeneTranscription factorSociology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Long non-coding RNAs (lncRNAs) are emerging as crucial regulators of beta cell function. Here, we show that an lncRNA-transcribed antisense to Pax6, annotated as Pax6os1/PAX6-AS1, was upregulated by high glucose concentrations in human as well as murine beta cell lines and islets. Elevated expression was also observed in islets from mice on a high-fat diet and patients with type 2 diabetes. Silencing Pax6os1 / PAX6-AS1 in MIN6 or EndoC-βH1 cells increased several beta cell signature genes' expression. Pax6os1/PAX6-AS1 was shown to bind to EIF3D, indicating a role in translation of specific mRNAs, as well as histones H3 and H4, suggesting a role in histone modifications. Important interspecies differences were found, with a stronger phenotype in humans. Only female Pax6os1 null mice fed a high-fat diet showed slightly enhanced glucose clearance. In contrast, silencing PAX6-AS1 in human islets enhanced glucose-stimulated insulin secretion and increased calcium dynamics, whereas overexpression of the lncRNA resulted in the opposite phenotype.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,844
Score d'incertitude au seuil0,338

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,276
Écart entre enseignants0,264 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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