Abstract A018: Somatic mutations in the <i>PIK3CA</i> gene and its prognostic implications among Ethiopian Breast cancer patients
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Purpose: The phosphatidylinositol-4, 5-bisphosphate 3-kinase (PIK3CA), catalytic subunit alpha (c) is frequently mutated in breast cancer (BC). Although the biological impact of PIK3CA mutations in BC has been studied in various parts of the world, limited data is available from sub-Saharan Africa. In this study, the frequency and the prognostic role of PIK3CA mutations were investigated among BC patients from Ethiopia. Objective: The aim of the study was to determine the frequency of PIK3CA mutations and its prognostic role in patients with breast cancer in Ethiopia. Methods: Formalin-fixed paraffin-embedded blocks and fresh frozen BC tissue samples were collected from patients newly diagnosed with BC. Histopathological evaluation was carried out using immunohistochemistry (IHC). PIK3CA mutation profiling was carried out using TaqMan® Mutation detection assay. The association between PIK3CA mutation status and clinical and histopathological features was evaluated. A survival regression (Cox’s model) was employed to assess the effect of PIK3CA mutation and other variables on survival. Results: The prevalence of the PIK3CA mutations was 20.4%. Mutation of the PIK3CA gene was mainly observed among younger (24%), early pT stage (19.4%), and G1/G2 tumors (22.3%). The proportion of mutation was 24.4%, 27.3% and 20% in ER+, PR+ and HER2- tumors, respectively. A marked difference was observed in the PIK3CA mutation frequency across the four major tumor subgroups. However, most of the mutated tumors were found among HR+/HER2− (24.1%) followed by HR+/HER2+ tumors (27.8%). In his study, only TNBC was negatively associated with the proportion of mutation in the PIK3CA gene (p-value= 0.02) in comparison to HR+/HER2- tumors. In multivariate Cox’s regression analysis, the advanced pT stage and HR−/HER2- IHC group independently predicted worse overall survival. However, PIK3CA mutation status was not associated with survival. Conclusions: The PIK3CA mutation was relatively high in HR+ tumors. Mutation rates of PIK3CA in Ethiopian BC tumors are similar to those reported for other populations. This finding highlighted that molecular aberrations including mutations in a specific could give insight on prognosis and clinical outcome. Citation Format: Zelalem Desalegn Woldesonbet. Somatic mutations in the PIK3CA gene and its prognostic implications among Ethiopian Breast cancer patients [abstract]. In: Proceedings of the AACR Special Conference in Cancer Research: Optimizing Therapeutic Efficacy and Tolerability through Cancer Chemistry; 2024 Dec 9-11; Toronto, Ontario, Canada. Philadelphia (PA): AACR; Mol Cancer Ther 2024;23(12_Suppl):Abstract nr A018.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».