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Enregistrement W4405182084 · doi:10.1158/1538-8514.cancerchem24-a008

Abstract A008: Evaluation of natural and synthetic compounds on epithelial to mesenchymal transition in triple negative breast cancer

2024· article· en· W4405182084 sur OpenAlexaboutno aff
Asef Faruk, Saloni Patel, Ramez Hallak, Patrick T. Flaherty, Jane Cavanaugh

Notice bibliographique

RevueMolecular Cancer Therapeutics · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueTannin, Tannase and Anticancer Activities
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésEpithelial–mesenchymal transitionVimentinTriple-negative breast cancerCancer researchMesenchymal stem cellCancerCancer cellMetastasisChemistryBreast cancerBiologyCell biologyImmunologyImmunohistochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Epithelial to mesenchymal transition (EMT) is a biological process through which epithelial cells undergo cytoskeletal changes and transform into a mesenchymal phenotype. This phenotypical transformation leads to enhanced migratory capabilities and increased resistance to apoptosis and drug therapies. The EMT characterized in part by an increase in vimentin, a mesenchymal marker, and a decrease in E-cadherin, an epithelial marker, plays a significant role in cancer metastasis and progression. The MEK5/ERK5 pathway is essential in regulating cell survival, proliferation, and migration. Inhibition of the MEK5/ERK5 pathway by small molecule inhibitors decreases cellular proliferation and impedes migration of cancer cells, including triple negative breast cancer (TNBCs) cells. A type III allosteric inhibitor of MEK5 designed by our collaborators reverses the EMT and induces a mesenchymal to epithelial transition (MET). Using a TNBC cell line, MDA-MB-231, genetically engineered with RFP tagged vimentin, we established a cellular assay to evaluate analogues of our lead type III inhibitor to further investigate the role of the MEK5-ERK pathway in the EMT, design optimal compounds that induce an MET, and explore structure-activity relationships for kinase inhibition. This research will help identify targets for EMT and optimize compound modification to improve potency and efficiency. Citation Format: Asef Faruk, Saloni Patel, Ramez Hallak, Patrick Flaherty, Jane Cavanaugh. Evaluation of natural and synthetic compounds on epithelial to mesenchymal transition in triple negative breast cancer [abstract]. In: Proceedings of the AACR Special Conference in Cancer Research: Optimizing Therapeutic Efficacy and Tolerability through Cancer Chemistry; 2024 Dec 9-11; Toronto, Ontario, Canada. Philadelphia (PA): AACR; Mol Cancer Ther 2024;23(12_Suppl):Abstract nr A008.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,016

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,308
Écart entre enseignants0,286 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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