Abstract A008: Evaluation of natural and synthetic compounds on epithelial to mesenchymal transition in triple negative breast cancer
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Epithelial to mesenchymal transition (EMT) is a biological process through which epithelial cells undergo cytoskeletal changes and transform into a mesenchymal phenotype. This phenotypical transformation leads to enhanced migratory capabilities and increased resistance to apoptosis and drug therapies. The EMT characterized in part by an increase in vimentin, a mesenchymal marker, and a decrease in E-cadherin, an epithelial marker, plays a significant role in cancer metastasis and progression. The MEK5/ERK5 pathway is essential in regulating cell survival, proliferation, and migration. Inhibition of the MEK5/ERK5 pathway by small molecule inhibitors decreases cellular proliferation and impedes migration of cancer cells, including triple negative breast cancer (TNBCs) cells. A type III allosteric inhibitor of MEK5 designed by our collaborators reverses the EMT and induces a mesenchymal to epithelial transition (MET). Using a TNBC cell line, MDA-MB-231, genetically engineered with RFP tagged vimentin, we established a cellular assay to evaluate analogues of our lead type III inhibitor to further investigate the role of the MEK5-ERK pathway in the EMT, design optimal compounds that induce an MET, and explore structure-activity relationships for kinase inhibition. This research will help identify targets for EMT and optimize compound modification to improve potency and efficiency. Citation Format: Asef Faruk, Saloni Patel, Ramez Hallak, Patrick Flaherty, Jane Cavanaugh. Evaluation of natural and synthetic compounds on epithelial to mesenchymal transition in triple negative breast cancer [abstract]. In: Proceedings of the AACR Special Conference in Cancer Research: Optimizing Therapeutic Efficacy and Tolerability through Cancer Chemistry; 2024 Dec 9-11; Toronto, Ontario, Canada. Philadelphia (PA): AACR; Mol Cancer Ther 2024;23(12_Suppl):Abstract nr A008.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,005 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».