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Enregistrement W4405221973 · doi:10.1093/jamia/ocae276

Returning value to communities from the <i>All of Us</i> Research Program through innovative approaches for data use, analysis, dissemination, and research capacity building

2024· article· en· W4405221973 sur OpenAlexaff
Suzanne Bakken, Elaine Sang, Berry de Brujin

Notice bibliographique

RevueJournal of the American Medical Informatics Association · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineHealth Professions
ThématiqueMobile Health and mHealth Applications
Établissements canadiensNational Research Council Canada
Organismes subventionnairesNational Institute of Nursing Research
Mots-clésLibrary scienceColumbia universityHealth informaticsInformaticsPolitical scienceMedicineGerontologySociologyPublic healthMedia studiesComputer scienceNursingLaw

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In 2015, the White House and the National Institutes of Health announced the inception of the All of Us Research Program “to bring us closer to curing diseases like cancer and diabetes, and to give each of us access to the personalized information we need to keep ourselves and our families healthier.” Now approaching the first decade, the vision to enhance innovation in biomedical research remains strong with the goal of moving the United States into an era where medical treatment and other health interventions can be tailored to individuals. As of October 2024, there are over 842 000 participants who have consented to participate in the All of Us Research Program. The resulting data set, which is accessed through the All of Us Public Data Brower (aggregated data only) or Researcher Workbench reflects three novel aspects: (1) enriched enrollment for racial, ethnic, sexual, gender, and geographic minority populations to correct for past sampling bias in precision medicine studies, (2) inclusion of social determinants of health (SDoH), electronic health record (EHR), and genomic data, and (3) designed for use by scientists with a broad variety of backgrounds and different research (eg, research-intensive universities, community-based organizations) and educational settings (eg, Historically Black Colleges and Universities, high schools).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,221
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,337
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesMétarecherche
DomaineSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,779
Score d'incertitude au seuil0,961

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,2210,337
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,002
Bibliométrie0,0110,011
Études des sciences et des technologies0,0100,011
Communication savante0,0290,026
Science ouverte0,0060,050
Intégrité de la recherche0,0050,013
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0170,008

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,394
Tête enseignante GPT0,578
Écart entre enseignants0,185 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; l’étiquette directe de Gemma et le classifieur distillé Codex s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeSans objet
DomaineMéthodes
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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