Continuous indices to assess the phenotypic spectrum of kidney transplant rejection
Notice bibliographique
Résumé
The international Banff classification for kidney transplant pathology discretizes the rejection continuum into distinct diagnostic categories, introducing artificial dichotomization and threshold effects. To better reflect the underlying disease spectrum, we developed, in this cohort study, two novel indices for quantifying antibody-mediated (AMR) and T-cell mediated rejection (TCMR) from histological lesion scores, and calculated indices for overall activity and chronicity. These indices were evaluated in one derivation cohort and two independent validation cohorts, totaling 19,500 biopsies from 8,873 kidney transplant patients across 10 centers worldwide. The AMR, TCMR, and activity indices demonstrated hierarchical ordering between No rejection, intermediate and complete rejection histology. The chronicity index showed limited association with the major diagnostic categories. In the derivation cohort, the AMR and TCMR indices discriminated AMR from absence of AMR, and TCMR from absence of TCMR, with an AUC of 0.98 (95% confidence interval 0.97 to 0.98) and 0.99 (0.99 to 1.00) respectively). This excellent discrimination was confirmed in the validation cohorts. Those indices strictly confined intermediate phenotypes to a range of low index values and related to graft failure rates even within the diagnostic categories, thus reflecting the underlying rejection continuum. The four continuous indices offer an implementable and interpretable global evaluation of kidney transplant biopsy histology while eliminating the need for intermediate diagnostic categories and enable more probabilistic reasoning in the diagnostic approach to the spectrum of kidney transplant rejection.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,009 | 0,019 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,004 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,002 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».